培訓日程

9月21日

8:30-9:30 ????數(shù)據(jù)挖掘介紹

??????????????數(shù)據(jù)挖掘簡介

??????????????數(shù)據(jù)的來源（可利用的數(shù)據(jù)、不同數(shù)據(jù)的異同點、不同數(shù)據(jù)的挖掘方法）

9:31-10:30 ???臨床研究中生信數(shù)據(jù)應用實例分析與研究思路

??????????????公共數(shù)據(jù)庫在臨床科研應用中的應用思路

??????????????生信技術在臨床研究中的應用思路及文獻實例解析

10:45-12:45 ??R語言基礎實操（上）

??????????????數(shù)據(jù)分析處理

14:00-15:00 ??R語言基礎實操（下）

??????????????常用圖表的制作

15:15-18:15 ??公共數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)檢索、下載與分析處理

??????????????TCGA數(shù)據(jù)庫的功能介紹及實操

??????????????GEO數(shù)據(jù)庫的功能介紹及實操

??????????????其他相關數(shù)據(jù)庫的功能介紹及實操

9月22日

8;30-11:30 ???生物醫(yī)學組學數(shù)據(jù)挖掘

??????????????聚類分析（概念、常用聚類方法及R軟件實現(xiàn)與可視化）

分類分析（決策樹與隨機森林原理、構(gòu)建及結(jié)果的可視化等）

主成分分析（概念，應用及案例解析）

Logistic回歸分析與生存分析（列線圖及校準圖繪制）

基因R的CancerSubtypes軟件包的腫瘤亞型分析

10:45-12:45 ??基于數(shù)據(jù)挖掘的疾病關鍵調(diào)節(jié)分子（上）

??????????????基于數(shù)據(jù)挖掘?qū)ふ谊P鍵疾病調(diào)控分子

??????????????網(wǎng)絡拓撲性質(zhì)簡介、分子網(wǎng)絡數(shù)據(jù)庫介紹

??????????????案例講解：應用網(wǎng)絡拓撲性質(zhì)識別疾病關鍵調(diào)控分子

14:00-15:00 ??基于數(shù)據(jù)挖掘的疾病關鍵調(diào)節(jié)分子的探索（下）

??????????????構(gòu)建網(wǎng)絡及可視化（Cytoscape）

??????????????Cytoscape軟件介紹、Cytoscape插件簡介

15:01-16:00 ??臨床樣本檢測驗證、后續(xù)結(jié)果分析與論文組裝

??????????????解讀生物數(shù)據(jù)與臨床數(shù)據(jù)的整合分析思路

??????????????基于GEO與TCGA公共數(shù)據(jù)庫挖掘的SCI論文寫作與發(fā)表

? ? ? ? ? ? ?腫瘤基因表達與免疫浸潤的最新研究熱點