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        首頁 > 商務會議 > 醫(yī)療醫(yī)學會議 > 2018宏基因組分析專題研討班 更新時間:2018-10-26T10:52:54

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        2018宏基因組分析專題研討班
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        官方合作

        2018宏基因組分析專題研討班 已截止報名

        會議時間: 2018-12-01 09:30至 2018-12-02 17:00結束

        會議地點: 北京  北京市計算中心  海淀區(qū)豐賢中路7號 周邊酒店預訂

        主辦單位: 中國生物工程學會計算生物學與生物信息學專委會

        行業(yè)熱銷熱門關注看了又看 換一換

              會議介紹

              會議內容 主辦方介紹


              2018宏基因組分析專題研討班

              2018宏基因組分析專題研討班 宣傳圖

              計算中心生物部一直以來都以最前沿的課程、理論與實踐相結合和高品質的服務為廣大科研工作者提供全面的生物信息課程。

              為了解決科研工作者在宏基因組樣品制備、數(shù)據(jù)分析、功能基因挖掘等的困擾,生物部特推出《宏基因組分析專題研討班》。專業(yè)的講課老師團隊與您一起交流,解決您的困擾、探討科研奧秘、拓寬科研思路、挖掘科學價值,歡迎您報名參加!

              【主辦單位】

              中國生物工程學會計算生物學與生物信息學專委會?

              【承辦單位】

              北京市計算中心?

              【協(xié)辦單位】

              云計算關鍵技術與應用北京市重點實驗室?

              中國醫(yī)藥生物技術學會生物醫(yī)學信息技術分會?

              北京市基因測序與功能分析工程技術研究中心?

              中國生物工程雜志?

              北京唐唐天下生物醫(yī)學信息科技有限公司

              北京微生太科技有限公司

              北京依托華茂生物科技有限公司

              【培訓地點】

              北京海淀區(qū)豐賢中路7號3號樓,北京市計算中心三層會議室?

              【培訓時間】

              2018年9月1日-2日??上午:9:30-12:00?下午:1:30–5:00

              查看更多

              中國生物工程學會計算生物學與生物信息學專委會 中國生物工程學會計算生物學與生物信息學專委會

              中國生物工程學會(Chinese Society of Biotechnology,CSBT)成立于1993年,首任理事長:談家楨院士,現(xiàn)任理事長:高福院士。中國生物工程學會成立以來,主辦、承辦、協(xié)辦了多個國際、國內學術交流活動,為促進生物技術與生物產業(yè)發(fā)展、提高國民素質、促進經濟和社會發(fā)展等方面發(fā)揮了重要作用。

              會議日程 (最終日程以會議現(xiàn)場為準)


              日期

              授課題目

              授課內容

              第一天

              宏基因學研究的發(fā)展和挑戰(zhàn)

              1、宏基因組研究的發(fā)展歷史?
              2、典型的宏基因組研究及應用?
              3、兩種宏基因組研究的策略?
              4、宏基因組數(shù)據(jù)分析中的挑戰(zhàn)?
              5、數(shù)據(jù)分析過程中的編程簡介

              QIIME在宏基因組分析中的應用(上機操作)

              1.linux常用命令使用和上機操作?
              2、單樣品物種多樣性分析?
              A)序列聚類OTUs(Operational Taxonomic Units)?
              B)測序深度判定(Rarefaction Curve)?
              C)物種多樣性及豐度分析(Relative Abundances)?
              3、多樣品物種多樣性分析,包括以下內容:?
              A)多樣品OTUs比較(OUT Heatmap、Venn圖)?
              B)多樣品相似度比對(UPGMA?聚類分析)?
              C)多樣品群落構成比較分析(柱狀圖)?
              D)Weighted PCA(Principal Component Analysis)分析?
              E)Unweighted PCA分析?
              F)組間差異顯著性分析

              第二天上午

              基于shotgun測序的宏基因組數(shù)據(jù)分析技術

              一、WGS測序分析的一般流程?
              1?流程概覽?
              2?文庫構建和測序方式選擇?
              3?質量控制和污染序列去除?
              4?序列整合和分選?
              5 NR-BLAST和MEGAN分析?
              6?序列拼接和基因預測注釋?
              7?循環(huán)處理?
              二、經常使用的數(shù)據(jù)資源和工具(重點)?
              1 NR/MG-RAST和reference
              2 RAPSearch和alignment
              3 MEGAN和classification
              4 SOAP-denovo和assembly
              5 BWA/inGAP和mapping
              三、數(shù)據(jù)統(tǒng)計與結果展示(重點)?
              1?測序量和拼接效率?
              2?從比對文件中提取信息?
              3?物種/功能分類和組成?
              4?群落結構多樣性?
              5?聚類和相關性?
              6?其它……?
              四、WGS測序分析的典型案例?
              1?人類微生物組計劃-HMP
              2?地球微生物組計劃-EMP
              3?反芻動物胃宏基因組?
              4?環(huán)境病毒組和噬菌體?
              5?從相關案例看WGS的優(yōu)勢?
              五、一些工具的操作演示(上機)

              第二天下午

              宏基因組研究的難點:宏基因組拼接\非拼接策略的數(shù)據(jù)分析

              1.宏基因組拼接必要性?
              2.基因組拼接組裝算法原理和流程?
              3.?宏基因組拼接的特點及難點?
              4.?基于非拼接的宏基因組研究策略?
              5.上機操作,演示SOAPdenovo2, MetaIDBA,?SPAdes等軟件的使用

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              會議嘉賓


              即將更新,敬請期待

              參會指南

              會議門票 場館介紹


              【收費標準】注冊費2800元/人,包括學費、材料費、上機費。培訓期間可免費提供午餐。材料:《高通量測序與高性能計算理論和實踐》北京科學技術出版社。附近最近酒店為:如家酒店(永豐店),可自行網上預定,住宿自理。

              【報名優(yōu)惠政策】

              ???1、11.16日前報名并繳費的學員每人可優(yōu)惠300元;

              ?? 2、3人以上團體報名每人可減少300元;

              ?? 3、4+1團報,可免費贈送一個名額;?

              ???4、同時報2個以上培訓班的可額外優(yōu)惠200元;

              ???5、上面4種優(yōu)惠政策不能同時享受,只能享受其中一種。

              查看更多

              北京市計算中心 北京市計算中心

              北京市計算中心建立于一九七三年,是國內最早一批計算中心之一,是中國最早、最具影響力的從事計算機應用技術研究及推廣的機構,服務對象則涉及工業(yè)、商業(yè)、交通、能源、環(huán)保金融、稅務、社會事務等多個領域。北京市計算中心自成立以來,完成了上百項國家和北京市政府有關部門委托的研究項目和面向多種用戶的服務型項目。先后獲得國家及省部級成果獎30多項、,擁有了200余項國際國內領先的技術和產品,為中國計算機的普及、應用和發(fā)展做出了杰出貢獻

              溫馨提示
              酒店與住宿: 為防止極端情況下活動延期或取消,建議“異地客戶”與活動家客服確認參會信息后,再安排出行與住宿。
              退款規(guī)則: 活動各項資源需提前采購,購票后不支持退款,可以換人參加。

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