高通量數(shù)據(jù)庫挖掘與網(wǎng)絡(luò)圖構(gòu)建分析研討會2019(11月上海班)
時間:2019-11-16 08:00 至 2019-11-17 18:00
地點:上海

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![]() 高通量數(shù)據(jù)庫挖掘與網(wǎng)絡(luò)圖構(gòu)建分析研討會2019(11月上海班) 已截止報名會議時間: 2019-11-16 08:00至 2019-11-17 18:00結(jié)束 會議地點: 上海 上海浦東中興和泰酒店 浦東新區(qū)科苑路866號 周邊酒店預(yù)訂 主辦單位: 上海遐永醫(yī)藥科技 醫(yī)藥加科研培訓(xùn)中心 上海遐錦生物科技有限公司
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會議介紹
會議內(nèi)容 主辦方介紹
高通量數(shù)據(jù)庫挖掘與網(wǎng)絡(luò)圖構(gòu)建分析研討會2019(11月上海班)宣傳圖
高通量數(shù)據(jù)庫挖掘與網(wǎng)絡(luò)圖構(gòu)建分析研討會
(上海·浦東?2019.11.16-17)
生物信息學(xué)(bioinformatics)定義:是在大分子方面的概念型的生物學(xué),并且使用了信息學(xué)的技術(shù),這包括了從應(yīng)用數(shù)學(xué)、計算機科學(xué)以及統(tǒng)計學(xué)等學(xué)科衍生而來各種方法,并以此在大尺度上來理解和組織與生物大分子相關(guān)的信息。
會議目的:
很多老師都做過測序或者芯片實驗,雖然測序公司已經(jīng)給出了一部分的數(shù)據(jù)分析,比如過濾、質(zhì)控、比對、定量和差異等,但是這些分析屬于基礎(chǔ)傻瓜式的標(biāo)準(zhǔn)分析,并不能完整的講一個故事!因此,需要我們自己掌握高通量數(shù)據(jù)挖掘的能力,從海量信息中獲得自己想要的關(guān)鍵基因!
會議預(yù)期:通過2天的培訓(xùn),使學(xué)員掌握生信文獻(xiàn)分析思路和8個實用操作知識點(具體見最后),可以獨立完成一篇基于公共數(shù)據(jù)庫的高通量數(shù)據(jù)挖掘分析。
生物信息學(xué)魅力:
幫助預(yù)測疾病相關(guān)的潛在基因,以及該基因潛在的作用靶點、上游調(diào)控轉(zhuǎn)錄因子等,從而指導(dǎo)實驗方向、縮小試驗范圍、簡化試驗流程。
為基金申請?zhí)峁┲С?,通過強大的信息數(shù)據(jù)的收集整理,減少投入增強研究目的性;且通過整合技術(shù)優(yōu)勢,指導(dǎo)提高臨床診斷水平。
豐富的免費的數(shù)據(jù)資源和生物軟件工具: 數(shù)據(jù)庫:NCBI, EBI, DDBJ, PDB, SWISS-PROT等;軟件工具:Cytoscape,BLAST, ?R語言,String, ?David等
案例:
我們可以看到該文獻(xiàn)主要的分析步驟有:差異表達(dá)分析、聚類熱圖構(gòu)建、GO和KEGG 通路分析、蛋白互作網(wǎng)絡(luò)分析、生存曲線分析等。我們的主題基本上按照類似的文獻(xiàn)思路進(jìn)行講解,和大家一起分享一下一篇SCI文章的生信分析步驟。
通過2~3天的學(xué)習(xí),我們可以掌握一篇生信SCI文獻(xiàn)的所有分析模塊,并可以獨立的結(jié)合自己的研究方向進(jìn)行生信分析和數(shù)據(jù)挖掘,獲得一套屬于自己的分析結(jié)果。
會議時間:2019年11月16-17日,15日可報到(下午3點-晚上8點)
會議地點:上海市浦東新區(qū)科苑路866號 中興和泰酒店?
報到地點:中興和泰酒店 ???????
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南京巴傲得生物科技有限公司(Biogottechnology,co,Ltd),是專一服務(wù)于生命科學(xué)研究的專業(yè)技術(shù)型企業(yè)。是一大批志同道合的資深專業(yè)人士共同創(chuàng)辦的具有現(xiàn)代化經(jīng)營管理水平的生物高科技企業(yè),從事生物技術(shù)產(chǎn)品的開發(fā)及銷售,致力于將巴傲得生物打造成中國乃至世界一流的生物技術(shù)產(chǎn)品供應(yīng)商。巴傲得生物長期備有Bioworld抗體現(xiàn)貨4000多種抗體可以在一周左右送到客戶的手里。精湛品質(zhì)、合理價格、專業(yè)服務(wù),是我們?yōu)槟?wù)的宗旨。在細(xì)胞信號通路、免疫學(xué)、蛋白組學(xué)上擁有顯著優(yōu)勢,其抗體產(chǎn)品、生長因子等為生命科學(xué)科研工作者提供了極大的便利。

舉辦了2018腸道菌群與代謝組學(xué)國自然課題設(shè)計及研究策略專題會議(12月北京班) 2019臨床預(yù)測模型構(gòu)建與基于R語言統(tǒng)計分析學(xué)習(xí)班(01.05-01.06北京班) 2019全國循證醫(yī)學(xué)Meta分析及網(wǎng)狀Meta三天精講學(xué)習(xí)班(1月北京班) 第10期測序與芯片高通量數(shù)據(jù)挖掘與分析學(xué)習(xí)班2019(1月上海班) 2019腸道菌群與代謝組學(xué)國自然課題設(shè)計及研究策略專題會議(1月上海班) 2019國自然基金標(biāo)書構(gòu)思與撰寫學(xué)習(xí)班(1月上海班) TCGA,GEO生信高通量數(shù)據(jù)挖掘?qū)n}學(xué)習(xí)班2019(1月上海班) 第8期醫(yī)學(xué)SCI論文寫作及發(fā)表技巧學(xué)習(xí)班2019(1月上海班) ......

上海遐錦生物科技有限公司于2019年11月29日舉辦全國循證醫(yī)學(xué)Meta分析與網(wǎng)狀Meta研討會2019(11月上海班)會議。
會議日程
(最終日程以會議現(xiàn)場為準(zhǔn))
測序與芯片的高通量數(shù)據(jù)挖掘與分析課程大綱 |
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日期 |
時間 |
題目 |
課程內(nèi)容 |
第一天上午 |
9:00-10:45 |
基因數(shù)據(jù)庫使用介紹 |
測序標(biāo)準(zhǔn)報告的解讀 NCBI Gene:最權(quán)威的基因綜合數(shù)據(jù)庫之一。 NCBI GEO: 數(shù)據(jù)量最大的高通量公共數(shù)據(jù)庫。 |
10:30-10:45 |
茶歇 |
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10:45-12:00 |
基因數(shù)據(jù)庫使用介紹 |
GEO2R工具:在線做差異分析的R工具 bioDBnet:在線基因ID轉(zhuǎn)換工具。 Uniprot: 最權(quán)威的蛋白綜合數(shù)據(jù)庫之一。 |
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? |
12:00-13:30 |
午餐及午休 |
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第一天下午 |
13:30-14:00 |
DAVID工具—功能富集分析 ? |
功能富集的原理和意義 基因ID轉(zhuǎn)換 |
14:00-15:30 |
基因功能注釋(GO ,KEGG pathway) |
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基因功能富集(GO ,KEGG pathway) |
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基因功能聚類(GO ,KEGG pathway) |
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15:30-15:45 |
茶歇 |
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15:45-18:00 |
聚類熱圖及pathway map圖 |
KEGG 數(shù)據(jù)庫:最權(quán)威的通路數(shù)據(jù)庫(pathway map 分析) |
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HEMI軟件:構(gòu)建聚類熱圖的本地軟件 |
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? |
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第二天上午 |
9:00-10:45 |
STRING工具——基因/蛋白相互作用分析(PPI) |
蛋白互作分析的原理和意義 |
單個蛋白的蛋白互作分析 |
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多個蛋白的蛋白互作分析 |
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STRING工具的使用步驟:輸入、參數(shù)設(shè)置、輸出等 |
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10:30-10:45 |
茶歇 |
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10:45-12:00 |
cytoscape網(wǎng)絡(luò)做圖軟件(上) |
網(wǎng)絡(luò)圖構(gòu)建 |
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逐個修改節(jié)點的屬性和修改邊的屬性 |
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網(wǎng)絡(luò)展示方式layout更美觀 |
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網(wǎng)絡(luò)統(tǒng)計分析 |
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? |
12:00-13:30 |
午餐及午休 |
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第二天下午 |
13:30-15:30 |
cytoscape網(wǎng)絡(luò)做圖軟件(下) |
批量修改節(jié)點的屬性和修改邊的屬性 |
Cytoscape的常用插件:ClusterONE |
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Cytoscape的常用插件:BinGO |
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15:30-15:45 |
茶歇 |
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15:45-16:30 |
課程總結(jié) |
課程總結(jié) |
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備注:必須攜帶電腦,上課軟件為Cytoscape,蘋果電腦務(wù)必自己裝好軟件 |
?
通過該主題的學(xué)習(xí),可以學(xué)會:
高通量公共數(shù)據(jù)的詳細(xì)信息查找/下載;
在線做差異表達(dá)分析
在線blast分析
基因ID轉(zhuǎn)換
通路map圖制作
功能富集分析
蛋白互作分析
網(wǎng)絡(luò)圖的構(gòu)建和美化。
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會議嘉賓
(最終出席嘉賓以會議現(xiàn)場為準(zhǔn))
講師簡介:
宋偉,交大生物信息學(xué)博士,參與完成了近百篇軟件著作權(quán)和發(fā)明專利的撰寫和申請;肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等數(shù)據(jù)庫的分析和構(gòu)建;完成個體基因檢測流程和無創(chuàng)唐篩流程的開發(fā)。有近十年的生信分析經(jīng)驗,擅長方向有轉(zhuǎn)錄組測序分析、芯片數(shù)據(jù)分析、疾病機理研究分析、疾病預(yù)后與基因關(guān)聯(lián)分析、項目分析思路設(shè)計以及個性化分析等,精通perl、R等編程語言。
培訓(xùn)經(jīng)歷:在上海、沈陽、濟南、武漢等城市舉辦過十幾場培訓(xùn)班。培訓(xùn)的對象有:醫(yī)生、學(xué)生、科研工作者、生信愛好者等。
培訓(xùn)方向:《測序與芯片數(shù)據(jù)分析》、《生物信息學(xué)的魅力》、《生信文章實例解讀》、《生信與實驗的密切關(guān)系》、《生信與臨床醫(yī)學(xué)的關(guān)系》、《生信實用工具培訓(xùn)》、《多組學(xué)整合分析流程》、《R語言培訓(xùn)》等
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參會指南
會議門票 場館介紹
收費標(biāo)準(zhǔn):會務(wù)費:2800元每位(包含電子版教材、午餐,住宿費自理。)
優(yōu)惠政策:
1. 提前確認(rèn)報名及轉(zhuǎn)賬的,可以提前拿到學(xué)習(xí)材料
2. 三人組團報名,每人優(yōu)惠100元
3. 四人組團報名,每人優(yōu)惠200元,
4. 五人組團報名繳費,額外帶一人免費注冊!?
可以開正規(guī)會務(wù)發(fā)票,紙質(zhì)邀請函(蓋紅章)。?
注意事項:攜帶windows系統(tǒng)的電腦。上課軟件為Cytoscape
房間價格:豪華大床/豪華標(biāo)間 500元/間,需通過主辦方預(yù)定?
主辦方:上海循掘生物科技中心
收費標(biāo)準(zhǔn):會務(wù)費:2800元每位(包含電子版教材、午餐,住宿費自理。)
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交通指南:
浦東張江地區(qū)駕車距離2.7公里(約6分鐘)、上海浦東國際機場駕車距離26.2公里(約42分鐘)、上海虹橋國際機場駕車距離30.5公里(約74分鐘)
上海中興和泰酒店位于浦東張江高科技園區(qū)的核心地帶,附近有地鐵二號線張江高科站,毗鄰新國際博覽中心、磁懸浮車站,距離迪士尼度假區(qū)20分鐘車程左右;周邊生活設(shè)施齊全,有集餐飲、KTV、電影院等休閑娛樂為一體的綜合性休閑廣場。
酒店占地面積一萬多平方米,屬園林景觀式酒店,擁有精心裝修的各式客房,環(huán)境優(yōu)雅、舒適,特設(shè)園林景觀房、湖景套房。同時酒店全面覆蓋WIFI,讓你隨時隨地享受網(wǎng)上沖浪的樂趣。
店內(nèi)有中、西餐廳、商務(wù)中心、大堂吧、10個中小型會議室、健身房、乒乓球室和SPA館,裝修溫馨舒適、服務(wù)貼心細(xì)致,讓你流連忘返。
溫馨提示
酒店與住宿:
為防止極端情況下活動延期或取消,建議“異地客戶”與活動家客服確認(rèn)參會信息后,再安排出行與住宿。
退款規(guī)則:
活動各項資源需提前采購,購票后不支持退款,可以換人參加。
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