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由中國(guó)人民大學(xué)數(shù)學(xué)科學(xué)研究院主辦的2015生物信息學(xué)與計(jì)算生物學(xué)大會(huì)于2015-11-28在中國(guó)人民大學(xué)舉辦。
首頁(yè)>演講嘉賓> 蘇計(jì)國(guó)更新時(shí)間:2015-11-28
蘇計(jì)國(guó),燕山大學(xué)副教授。主要研究方向是蛋白質(zhì)折疊機(jī)理及蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)-功能關(guān)系研究,為蛋白質(zhì)功能改造及合理的藥物設(shè)計(jì)提供理論基礎(chǔ)。近年來(lái),基于統(tǒng)計(jì)物理學(xué)理論,發(fā)展了一系列有效的簡(jiǎn)化模型和理論方法,成功應(yīng)用于蛋白質(zhì)折疊及蛋白質(zhì)變構(gòu)機(jī)制研究,深入探討了蛋白質(zhì)拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)及其動(dòng)力學(xué)特性與蛋白質(zhì)折疊和蛋白質(zhì)功能之間的內(nèi)在關(guān)系。主要研究工作有:1.基于彈性網(wǎng)絡(luò)模型,通過(guò)模擬計(jì)算和統(tǒng)計(jì)分析,揭示了蛋白質(zhì)拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)本身所固有的動(dòng)力學(xué)特性對(duì)其去折疊過(guò)程的重要影響。在此基礎(chǔ)上,根據(jù)統(tǒng)計(jì)物理學(xué)理論,發(fā)展了一種迭代的彈性網(wǎng)絡(luò)方法,把蛋白質(zhì)去折疊過(guò)程簡(jiǎn)化為一個(gè)緩慢升溫下的準(zhǔn)平衡過(guò)程,去折疊過(guò)程的每一步體系的熵增最大。所提出的理論方法能夠很好地預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)去折疊過(guò)程。2.根據(jù)統(tǒng)計(jì)熱力學(xué)理論,提出了一種熱力學(xué)微擾方法,成功應(yīng)用于蛋白質(zhì)構(gòu)象轉(zhuǎn)變中關(guān)鍵殘基的識(shí)別研究。該方法對(duì)蛋白質(zhì)體系內(nèi)的每一個(gè)殘基進(jìn)行微擾,能夠顯著改變蛋白質(zhì)構(gòu)象轉(zhuǎn)變前后自由能差的殘基認(rèn)為是構(gòu)象轉(zhuǎn)變中的關(guān)鍵殘基。所提出的方法理論嚴(yán)密、計(jì)算速度快,并且能夠特異性地考慮同一蛋白質(zhì)體系不同的變構(gòu)過(guò)程。3. 基于彈性網(wǎng)絡(luò)模型,提出了一種有效的熱力學(xué)方法,識(shí)別蛋白質(zhì)表面的變構(gòu)位點(diǎn),為基于結(jié)構(gòu)的藥物設(shè)計(jì)提供有價(jià)值的生物學(xué)信息。該方法通過(guò)計(jì)算蛋白質(zhì)表面不同部位與活性位點(diǎn)之間的熱力學(xué)耦合效應(yīng)來(lái)識(shí)別變構(gòu)位點(diǎn),預(yù)測(cè)結(jié)果與實(shí)驗(yàn)?zāi)軌蚝芎玫奈呛稀?. 把靜電相互作用加入到Gō模型中,對(duì)傳統(tǒng)的Gō模型進(jìn)行了改進(jìn),開(kāi)發(fā)了相關(guān)模擬程序包,利用所改進(jìn)的模型很好地揭示了靜電相互作用對(duì)冷休克蛋白熱穩(wěn)定性和折疊動(dòng)力學(xué)的影響。5. 基于相對(duì)熵理論和氨基酸HNP模型,對(duì)課題組其他研究者所開(kāi)發(fā)的蛋白質(zhì)折疊和蛋白質(zhì)設(shè)計(jì)程序包進(jìn)行了改進(jìn)和發(fā)展,進(jìn)行了小蛋白的結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)和序列設(shè)計(jì)研究,預(yù)測(cè)結(jié)果與實(shí)驗(yàn)?zāi)軌蚝芎玫奈呛??;趶?fù)雜網(wǎng)絡(luò)模型,研究了蛋白質(zhì)氨基酸網(wǎng)絡(luò)的結(jié)構(gòu)特征,通過(guò)網(wǎng)絡(luò)拓?fù)鋮⒘康姆治觯芯苛说鞍踪|(zhì)拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)對(duì)蛋白質(zhì)折疊的影響。
蘇計(jì)國(guó)出席會(huì)議日程
由中國(guó)人民大學(xué)數(shù)學(xué)科學(xué)研究院主辦的2015生物信息學(xué)與計(jì)算生物學(xué)大會(huì)于2015-11-28在中國(guó)人民大學(xué)舉辦。