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        2020年3月1日到期。滿 200 元可用
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        首頁(yè) > 培訓(xùn)課程 > 學(xué)術(shù)/科研培訓(xùn) > 宏基因組與代謝組/脂質(zhì)組學(xué)R軟件數(shù)據(jù)可視化研討會(huì)3月線上培訓(xùn)班 更新時(shí)間:2023-02-15T10:20:08

        宏基因組與代謝組/脂質(zhì)組學(xué)R軟件數(shù)據(jù)可視化研討會(huì)3月線上培訓(xùn)班
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        宏基因組與代謝組/脂質(zhì)組學(xué)R軟件數(shù)據(jù)可視化研討會(huì)3月線上培訓(xùn)班 已截止報(bào)名

        課程時(shí)間: 2023-03-25 09:00至 2023-03-26 18:00結(jié)束

        課程地點(diǎn): 線上活動(dòng) 

        主辦單位: 醫(yī)藥加科研培訓(xùn)中心 上海遐錦生物科技有限公司

        行業(yè)熱銷熱門(mén)關(guān)注看了又看 換一換

              會(huì)議介紹

              會(huì)議內(nèi)容 主辦方介紹


              宏基因組與代謝組/脂質(zhì)組學(xué)R軟件數(shù)據(jù)可視化研討會(huì)3月線上培訓(xùn)班

              宏基因組與代謝組/脂質(zhì)組學(xué)R軟件數(shù)據(jù)可視化研討會(huì)3月線上培訓(xùn)班宣傳圖

              宏基因組與代謝組/脂質(zhì)組學(xué)R軟件數(shù)據(jù)可視化研討會(huì)

              2023年3月25-26日 騰訊會(huì)議網(wǎng)絡(luò)會(huì)議室

              背景介紹

              微生物是自然界中分布最廣、種類最多、數(shù)量最大的生物類群。以腸道微生物為例,人體內(nèi)微生物的總數(shù)量約是人體細(xì)胞總數(shù)的10 —— 越來(lái)越多的研究發(fā)現(xiàn),腸道微生物與人體健康有著密切的關(guān)系,而微生物產(chǎn)生的代謝物是調(diào)控過(guò)程中最主要的中間遞質(zhì)之一。

              宏基因組研究包括16s測(cè)序和宏基因組測(cè)序,可以獲得微生物群落豐度以及組成。通過(guò)分析可以獲得關(guān)鍵菌群以及功能,為疾病治療提供研究基礎(chǔ)。

              代謝組學(xué)和脂質(zhì)組學(xué)是基于LC-MS液質(zhì)聯(lián)用技術(shù)對(duì)生物樣本中的小分子代謝物/脂質(zhì)分子進(jìn)行定性和相對(duì)定量分析。嚴(yán)格來(lái)講,脂質(zhì)組也是代謝組的一種。

              宏基因組-代謝組/脂質(zhì)組的聯(lián)合分析能夠從多個(gè)維度闡釋一個(gè)科學(xué)問(wèn)題,可以用來(lái)解釋差異菌群與差異代謝物的關(guān)聯(lián)性,從而幫助建立微生物-代謝物-表型之間的邏輯關(guān)系。

              基于以上原因,醫(yī)藥加推出宏基因組+代謝組/脂質(zhì)組聯(lián)合分析R軟件實(shí)操課程,帶您充分挖掘數(shù)據(jù),掌握生信高級(jí)分析能力。


              主要內(nèi)容詳細(xì)內(nèi)容見(jiàn)下文日程表

              1. 宏基因組生信文章解讀與報(bào)告解讀;
              2. RRstudio軟件安裝,宏基因組與代謝組/脂質(zhì)組學(xué)聯(lián)合分析實(shí)操;
              3. 生信SCI文章實(shí)用數(shù)據(jù)處理與圖片導(dǎo)出。

              【會(huì)議預(yù)期】

              本課程通過(guò)天的時(shí)間學(xué)習(xí)讓我們對(duì)宏基因組腸道菌群分析,代謝組脂質(zhì)組小分子分析,以及組學(xué)整合數(shù)據(jù)處理分析,有一個(gè)全面的了解。并使用R語(yǔ)言進(jìn)行分析及可視化作圖,得到SCI水平的圖片。

              講師簡(jiǎn)介

              宋偉博士

              成果:參與完成了近百篇軟件著作權(quán)和發(fā)明專利的撰寫(xiě)和申請(qǐng);肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等數(shù)據(jù)庫(kù)的分析和構(gòu)建;完成個(gè)體基因檢測(cè)流程和無(wú)創(chuàng)唐篩流程的開(kāi)發(fā)。

              研究方向:有近十年的生信分析經(jīng)驗(yàn),擅長(zhǎng)方向有轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析、芯片數(shù)據(jù)分析、疾病機(jī)理研究分析、疾病預(yù)后與基因關(guān)聯(lián)分析、項(xiàng)目分析思路設(shè)計(jì)以及個(gè)性化分析等,精通perl、R等編程語(yǔ)言。

              培訓(xùn)經(jīng)歷:在上海、北京、廣州、沈陽(yáng)、南京等城市舉辦過(guò)幾十場(chǎng)現(xiàn)場(chǎng)培訓(xùn)班。


              主辦方:上海遐錦生物科技有限公司

              會(huì)議時(shí)間2023年3月25-26

              會(huì)議地點(diǎn)線上:騰訊會(huì)議網(wǎng)絡(luò)會(huì)議室


              收費(fèi)標(biāo)準(zhǔn):會(huì)務(wù)費(fèi):線上:2800/人;

              優(yōu)惠政策:

              1.提前確認(rèn)報(bào)名及轉(zhuǎn)賬的,可以提前拿到學(xué)習(xí)材料

              2.三人組團(tuán)報(bào)名,每人優(yōu)惠100元

              3.四人組團(tuán)報(bào)名,每人優(yōu)惠200元,

              4.人組團(tuán)報(bào)名繳費(fèi),可免1人會(huì)務(wù)費(fèi)!

              可以開(kāi)正規(guī)會(huì)務(wù)發(fā)票,紙質(zhì)邀請(qǐng)函(蓋紅章)。

              注意事項(xiàng):必須攜帶win10以上系統(tǒng)的電腦,現(xiàn)場(chǎng)不得錄音錄像。上課軟件為R和Rstudio。會(huì)后主辦方會(huì)統(tǒng)一提供錄屏作為復(fù)習(xí)資料。


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              示例圖展示

              ?

              示例圖 箱線圖

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              示例圖 PCoA

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              示例圖 物種組成柱狀圖

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              示例圖 熱圖


              ?

              示例圖 venn

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              示例圖 PCA分析

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              示例圖 差異結(jié)果

              ?

              示例圖 代謝物的pathway map

              ?

              示例圖 Lefse樹(shù)狀圖

              ?

              示例圖 ?;鶊D


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              醫(yī)藥加科研培訓(xùn)中心 醫(yī)藥加科研培訓(xùn)中心

              舉辦了2018腸道菌群與代謝組學(xué)國(guó)自然課題設(shè)計(jì)及研究策略專題會(huì)議(12月北京班) 2019臨床預(yù)測(cè)模型構(gòu)建與基于R語(yǔ)言統(tǒng)計(jì)分析學(xué)習(xí)班(01.05-01.06北京班) 2019全國(guó)循證醫(yī)學(xué)Meta分析及網(wǎng)狀Meta三天精講學(xué)習(xí)班(1月北京班) 第10期測(cè)序與芯片高通量數(shù)據(jù)挖掘與分析學(xué)習(xí)班2019(1月上海班) 2019腸道菌群與代謝組學(xué)國(guó)自然課題設(shè)計(jì)及研究策略專題會(huì)議(1月上海班) 2019國(guó)自然基金標(biāo)書(shū)構(gòu)思與撰寫(xiě)學(xué)習(xí)班(1月上海班) TCGA,GEO生信高通量數(shù)據(jù)挖掘?qū)n}學(xué)習(xí)班2019(1月上海班) 第8期醫(yī)學(xué)SCI論文寫(xiě)作及發(fā)表技巧學(xué)習(xí)班2019(1月上海班) ......

              上海遐錦生物科技有限公司 上海遐錦生物科技有限公司

              上海遐錦生物科技有限公司于2019年11月29日舉辦全國(guó)循證醫(yī)學(xué)Meta分析與網(wǎng)狀Meta研討會(huì)2019(11月上海班)會(huì)議。

              會(huì)議日程 (最終日程以會(huì)議現(xiàn)場(chǎng)為準(zhǔn))


              會(huì)議日程


              宏基因組與代謝組學(xué)R語(yǔ)言分析及可視化會(huì)議日程

              時(shí)間安排

              課程表

              介紹

              第一天

              上午

              9:00- 10:15

              生信分析思路

              1. 生信簡(jiǎn)介;
              2. 宏基因組,代謝組,脂質(zhì)組簡(jiǎn)介;
              3. 宏基因組生信文獻(xiàn)解讀;
              4. 宏基因組與其他組學(xué)整合文獻(xiàn)解讀;
              5. 國(guó)自然宏基因組代謝組撰寫(xiě)思路;

              10:30-12:00

              R語(yǔ)言基礎(chǔ)

              1. R軟件與Rstudio軟件安裝;
              2. R基礎(chǔ)——類與對(duì)象(元素、向量、矩陣);
              3. R基礎(chǔ)——函數(shù);
              4. R基礎(chǔ)——路徑修改、
              5. R基礎(chǔ)——文件導(dǎo)入;文件保存(圖表等)
              6. R基礎(chǔ)——R包及安裝后續(xù)實(shí)操

              第一天

              下午

              13:30- 15:15

              標(biāo)準(zhǔn)報(bào)告解讀

              1. 16s測(cè)序分析報(bào)告解讀;
              2. 宏基因組測(cè)序分析報(bào)告解讀;
              3. 代謝組分析報(bào)告解讀;
              4. 脂質(zhì)組分析及報(bào)告解讀

              15:30-17:30

              宏基因組生信分析R實(shí)操(一)

              1. α多樣性分析
              2. β多樣性分析;
              3. 物種組成柱狀圖;
              4. 物種熱圖分析綱目科屬
              5. LeFse分析樹(shù)形圖分析。


              第二天

              上午

              9:00-10:15

              宏基因組生信分析R實(shí)操(二)

              1. 菌群無(wú)監(jiān)督PCA分析;
              2. 菌群有監(jiān)督OPLS/DA分析
              3. 差異菌群分析logFC , Pvalue
              4. 差異菌火山圖與差異基因熱圖;

              10:30-12:00

              代謝組脂質(zhì)組生信分析R實(shí)操

              1. 液相色譜LCMS的陽(yáng)離子(POS)陰離子(NEG)模式分析;
              2. 代謝物的有監(jiān)督和無(wú)監(jiān)督聚類;
              3. 差異代謝物分析(logFC , Pvalue, VIP
              4. 差異代謝物火山圖與差異基因熱圖;

              第二天

              下午

              13:30-15:15

              宏基因組代謝組數(shù)據(jù)多組學(xué)整合生信分析R實(shí)操

              1. 功能通路富集分析氣泡圖
              2. 16s與代謝組整合共表達(dá)分析。
              3. ?;鶊D分析

              15:30-17:00

              宏基因組代謝組數(shù)據(jù)多組學(xué)整合生信分析在線工具實(shí)操

              1. metaboAnalyst數(shù)據(jù)庫(kù)通路富集;
              2. Venn圖在線工具;
              3. Pathway map圖制作
              4. 疾病與菌屬關(guān)聯(lián)Disbiome database
              5. gutMDisorder | 疾病和干預(yù)中腸道微生物群失調(diào)的綜合數(shù)據(jù)庫(kù)
              6. GMrepo數(shù)據(jù)庫(kù)

              17:15-17:30

              答疑






              ???????

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              會(huì)議嘉賓


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              票種名稱 價(jià)格 原價(jià) 票價(jià)說(shuō)明
              會(huì)務(wù)費(fèi) ¥2800

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              酒店與住宿: 為防止極端情況下活動(dòng)延期或取消,建議“異地客戶”與活動(dòng)家客服確認(rèn)參會(huì)信息后,再安排出行與住宿。
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              標(biāo)簽: R軟件 宏基因組 科研

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