第十期中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究技術(shù)專題會議

2019/7/27-28 相聚上海 期待您的到來……

課程簡介

近年來國際上傾向于用多靶點藥物治療復(fù)雜疾病，中藥復(fù)方因其多成分、多靶點的特點在國際醫(yī)學(xué)界及藥物發(fā)現(xiàn)領(lǐng)域獲得了較高的關(guān)注,成為中藥現(xiàn)代化的重要機遇。國家在中藥研究方面也有很大力度的投入和支持，中藥復(fù)方的研究已成為近年來研究的熱點和國家自然基金重點扶持的領(lǐng)域。然而，由多種天然產(chǎn)物配伍而成的中藥復(fù)方，存在成分復(fù)雜、靶點和機制不清的問題，其研究難度很大，尤其是在SCI論文發(fā)表過程中難以獲得認可。

將網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)應(yīng)用于中藥復(fù)方研究，打破了傳統(tǒng)的中藥復(fù)方機制研究的瓶頸，使得原先難以定性的機制得以預(yù)測和驗證。作為臨床醫(yī)生、科研人員和碩博士研究生，尤其是沒有生物信息學(xué)分析基礎(chǔ)和網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)基礎(chǔ)的初學(xué)者，面對自己實驗獲得的大量錯綜復(fù)雜的基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)時，難免會無從下手分析。不知道如何去解析一個中藥復(fù)方的作用機制，如何去挖掘成分-靶點之間的關(guān)系，如何將藥物作用機制和疾病機制相關(guān)聯(lián)？如何利用免費的數(shù)據(jù)挖掘，為自己的中藥復(fù)方研究增添亮點？如何利用生物信息學(xué)技術(shù)，解析中藥復(fù)方作用機制？

本次學(xué)習(xí)會議將邀請長期從事網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究的專業(yè)人士,結(jié)合個人實踐經(jīng)驗, 帶領(lǐng)廣大學(xué)員，共同學(xué)習(xí)將網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的研究方法用于中藥復(fù)方研究。講課內(nèi)容涉及網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的數(shù)據(jù)獲取、分析方法、論文撰寫、項目設(shè)計、基金申請等方面?，F(xiàn)場實戰(zhàn)教學(xué)，帶領(lǐng)學(xué)員解析中藥復(fù)方作用機制，學(xué)員也可以將自己的實驗數(shù)據(jù)帶來學(xué)習(xí)班，利用課間時間進行分析。

課程內(nèi)容、目標與特色

本次學(xué)習(xí)班課程將以最簡單易懂的方式介紹復(fù)雜疾病和中藥復(fù)方研究所用到的網(wǎng)絡(luò)生物學(xué)的數(shù)據(jù)、方法和技術(shù)，并以中藥復(fù)方解析的工作流程為線索，講授如何一步一步地研究復(fù)雜疾病和挖掘中藥復(fù)方的作用機制。本學(xué)習(xí)班全部采用免費數(shù)據(jù)庫和在線分析工具，學(xué)員不需要編寫程序。

本次學(xué)習(xí)班全程電腦實戰(zhàn)教學(xué)，90%以上為上機指導(dǎo)操作，無繁瑣的理論授課，做到課程學(xué)完，就能獨立分析復(fù)雜疾病、解析中藥復(fù)方。老師將長期在學(xué)習(xí)群解答學(xué)員問題。

適合對象

各級醫(yī)院臨床醫(yī)生、藥師、科研單位研究人員、高校碩/博士研究生、對利用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究復(fù)雜疾病、藥物機制及中藥復(fù)方感興趣的廣大師生（尤其適合初學(xué)者和無基礎(chǔ)的學(xué)員，無需任何基礎(chǔ)，也無需學(xué)習(xí)任何編程語言，輕松分析復(fù)雜疾病和中藥復(fù)方）。

時間地點：

上海維也納酒店天山西路店 2019/7/27-28（26日報到）上海閔行區(qū)天山西路4086號

主辦單位：

莫速乎科研會議平臺（上海莫速乎教育投資有限公司）；上海荊麥信息科技中心

注：請自帶電腦以備學(xué)習(xí)使用。

內(nèi)容安排

第一天：網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)基礎(chǔ)知識、數(shù)據(jù)來源和實用技能

（一）網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)基礎(chǔ)知識

1.???????? 網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的研究思路

2.???????? 分析網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)SCI論文2篇，解析數(shù)據(jù)分析要點和論文寫作模式

（二）網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)數(shù)據(jù)獲取

1.???????? 中藥有效成分以及對應(yīng)靶點的查找和獲取、對比藥物及其靶點的獲?。ㄉ蠙C實踐）。介紹分子對接方法、化學(xué)相似性方法以及數(shù)據(jù)庫查詢方法獲取中藥有效成分的靶點；介紹PubChem, STITCH,DrugBank等數(shù)據(jù)庫的使用方法。主要內(nèi)容：

1)?? 常用中藥數(shù)據(jù)庫及使用方法：如何從數(shù)據(jù)庫獲取中藥有效成分，如何進行ADME篩選，如何獲取化合物的靶標？

2)?? 西藥數(shù)據(jù)庫及使用方法：如何獲取某種疾病的西藥和對應(yīng)靶標？

3)?? 蛋白質(zhì)信息數(shù)據(jù)庫及使用方法：如何進行靶蛋白的名稱、ID轉(zhuǎn)換？

4)?? 化合物信息數(shù)據(jù)庫及使用方法：如何獲取中藥小分子的結(jié)構(gòu)、靶標？

5)?? 用化學(xué)相似性預(yù)測化合物靶點

6)?? 基于藥效團模型的藥靶預(yù)測

7)?? 用分子對接驗證化合物的靶點

2.???????? 查找和獲取中藥所治療疾病的相關(guān)基因（上機實踐）。以Alzheimer's disease 為例，介紹如何在OMIM, DisGeNet查詢與疾病相關(guān)的基因。

3.???????? GEO數(shù)據(jù)庫中疾病相關(guān)基因芯片數(shù)據(jù)的獲取和分析（上機實踐）

（三）網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的數(shù)據(jù)分析（上機實踐）

1.???????? 靶點富集分析：DAVID、Metascape等工具的使用方法及結(jié)果解析

2.???????? 基于基因表達譜數(shù)據(jù)查找藥物作用機制

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第二天：網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)實用技能、研究案例、基金申請

（一）網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建、分析、美化:Cytoscape軟件的詳細講解（上機實踐）

1.???????? 靶標網(wǎng)絡(luò)、疾病網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建和分析

2.???????? 藥物-靶標相互作用網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建和分析

3.???????? 藥物-靶標-通路網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建和分析

4.?? 網(wǎng)絡(luò)拓撲特征的計算；網(wǎng)絡(luò)拓撲指標的含義；重要節(jié)點識別；模塊分解；網(wǎng)絡(luò)可視化和美化；Cytoscape插件的安裝和使用等

（二）網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)常用圖形繪制

維恩圖、通路富集圖等的繪制

（三）網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究案例

詳細解讀若干篇SCI論文的研究思路和研究方法

（四）網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的基金申請和項目設(shè)計