隨著深度測序技術(shù)的發(fā)展與成熟，產(chǎn)生了海量的基因組/表觀基因組的數(shù)據(jù)（包括各類常見和罕見變異、insertion/deletion, CNVs, RNA-seq, mRNA-seq, methylation-seq and Chip-seq），統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)和系統(tǒng)生物學(xué)方法是當(dāng)前研究多基因復(fù)雜疾病易感性，復(fù)雜疾病的發(fā)生機(jī)制和疾病防治與藥物開發(fā)的主要技術(shù)手段，并將成為我國基因組醫(yī)學(xué)自主創(chuàng)新的重要條件。越來越多的證據(jù)表明，復(fù)雜疾病是由多基因，基因-基因相互作用，基因與環(huán)境相互作用所引起的。這些基因和基因，基因與環(huán)境的相互作用，或者更廣泛地說遺傳，表觀遺傳和環(huán)境形成一個多層次的復(fù)雜生物網(wǎng)絡(luò)。正是這些復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)的變異引起了疾病的發(fā)生與發(fā)展。研究疾病的發(fā)生與發(fā)展的主要工具是統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)和計(jì)算系統(tǒng)生物學(xué)。統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)運(yùn)用遺傳學(xué)與數(shù)學(xué)的理論和方法，歸納整合群體遺傳學(xué)、遺傳流行病學(xué)、數(shù)量遺傳學(xué)、生態(tài)遺傳學(xué)和分子遺傳學(xué)等分支學(xué)科內(nèi)容，涉及遺傳連鎖分析、遺傳關(guān)聯(lián)分析、群體遺傳結(jié)構(gòu)與分化分析等眾多內(nèi)容。特別是隨著Illumina,ABI 等公司新的測序技術(shù)的推廣應(yīng)用，基于大規(guī)模全基因組測序數(shù)據(jù)的深度分析將成為多基因復(fù)雜疾病遺傳易感性關(guān)系和基因定位研究的主要方法。

（2015青海民族學(xué)院-復(fù)旦大學(xué)統(tǒng)計(jì)遺傳與基因組學(xué)講習(xí)班）

然而，針對這種全基因深度測序數(shù)據(jù)的分析，統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)面臨著巨大挑戰(zhàn)和革命性變化，本講習(xí)班將提供標(biāo)準(zhǔn)多變量分析到功能數(shù)據(jù)分析、獨(dú)立取樣數(shù)據(jù)到非獨(dú)立取樣數(shù)據(jù)、低解析度數(shù)據(jù)到高解析度數(shù)據(jù)、單個基因組/表觀基因組變異到多個整合基因組/表觀基因組數(shù)據(jù)分析的全套解決方案。目前，國際上在該領(lǐng)域的試驗(yàn)設(shè)計(jì)和統(tǒng)計(jì)分析技術(shù)進(jìn)展很快，本次講習(xí)班的目的就是為中美統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)領(lǐng)域的專家學(xué)者、計(jì)算系統(tǒng)生物學(xué)家、從事復(fù)雜疾病遺傳易感性研究的專業(yè)人員、生物信息科學(xué)工作者、研究生提供一個互相交流的平臺，并為今后的項(xiàng)目交流和相互合作創(chuàng)造條件。

會議主題：統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)與基因組學(xué)

We recognize that next generation sequencing technologies have?raised expectations for new genomic and epigenomic knowledge that will be translatable into novel therapeutics and insights into human health issues. However, immense biomedical complexities obstruct clinically valuable discoveries hidden under the deluge of high dimensional data and extensive analyses. To develop new analytic paradigms and novel statistical methods for sequence-based genomic and epigenomic data analysis needs to overcome the serious limitations of?the current paradigms and statistical methods for genomic and epigenomic data analysis which has mainly been designed for microarray data. We will also need to confront the great challenges of genomic and epigenomic data analysis raised by the?next-generation sequencing (NGS).

By this workshop, we will gain insights of the statistical challenges arising from next-generation sequencing data analysis and foster discussions about the paradigm shift in genomic and epigenomic data analysis. The presented concepts, methods and algorithms will open a new avenue for the attendee on the analysis of growing bigger and bigger genomic and epigenomic data generated by the NGS.

2015年6月1日?會議注冊報(bào)到（全天上午8：00-23：00）地點(diǎn):青海民族學(xué)院生命科學(xué)學(xué)院

2015年6月2 日?上午：開幕式主題發(fā)言、特邀報(bào)告（金力）

1. Big genomic, epigenomic, physiological and imaging data analysis (Momiao Xiong)

(1) Association Analysis with next-generation sequencing (NGS) data?(Momiao Xiong)

(2) Genotype-phenotype Network Analysis (Momiao Xiong)

(3) Causal Inference as a Unified Framework for Integrative Analysis of Genomic, Epigenomic, Physiological and Imaging Data Analysis (Momiao Xiong)

下午專題課：統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)理論方法培訓(xùn)與研討

1．復(fù)雜疾病基因定位中的連鎖分析方法及fbat/pBAT上機(jī)實(shí)習(xí)（YinYao）

2.?群體基因組學(xué)與基因定位研究（徐書華）

2015年6月3 日?上午: 特邀報(bào)告（鐘楊）

2. Interaction analysis with NGS Data

(1) Qualitative trait (Momiao Xiong)

(2) Quantitative trait (Momiao Xiong, Futao Zhang)

(3) Interaction analysis with functional response data and its application to sleep apnea (Momiao Xiong)

(4) Nonlinear Structural Equation and Its Application to Interaction Analysis (Momiao Xiong)

(5)?softwarefor interaction analysis with NGS data (Momiao Xiong, Futao Zhang)

下午專題課：統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)理論方法培訓(xùn)與研討

1.?群體遺傳結(jié)構(gòu)對關(guān)聯(lián)分析的影響（何云剛）

2.?人類群體中正向選擇信號的檢測（汪思佳）

2015年6月4 日?上午： 特邀報(bào)告（盧大儒）

3. Historical and Modern psychiatry genetics (Yin Yao)

(a) Moving from Common to Rare variants

(b) Moving from gene-based to pathway-based analysis, a lesson learned from OCD drug effect study

下午專題課：比較基因組學(xué)和分子進(jìn)化中的統(tǒng)計(jì)分析方法（谷迅）

上機(jī)實(shí)習(xí)（蘇志熙）

2015年6月5日?上午： 特邀報(bào)告（日本專家長谷川政美）

4.?Family-based association studies for common and rare analysis

(1) Family-based association analysis: from candidate gene to Gwas and NGS (weighted and un-weighted, Yin Yao)

(2) Integration analysis of gene expression and SNP data (Yin Yao)

(3) Analysis of gene expression microarray data (Huiqi Qu)

下午專題課：全基因組測序數(shù)據(jù)分析（周雁）

理解復(fù)雜的轉(zhuǎn)錄組：從頭到尾(倪挺)

上機(jī)實(shí)習(xí)(倪挺等)

2015年6月6日?市區(qū)生物多樣性考察

2015年6月7日?代表離會

會議注冊費(fèi)：

2015年4月30日前注冊：

正式代表：3000元/人

學(xué)生代表（博士、碩士研究生）：2800?元/人

2015年4月30日后注冊：

正式代表：3600元/人

學(xué)生代表（博士、碩士研究生）：3200?元/人

注冊費(fèi)包含資料費(fèi)、餐費(fèi)。