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        首頁 > 培訓(xùn)課程 > 生物/醫(yī)學(xué)培訓(xùn) > 多組學(xué)數(shù)據(jù)整合挖掘與分析(網(wǎng)絡(luò))研討會(huì)11月線上 更新時(shí)間:2020-10-14T16:58:37

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        多組學(xué)數(shù)據(jù)整合挖掘與分析(網(wǎng)絡(luò))研討會(huì)11月線上
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        多組學(xué)數(shù)據(jù)整合挖掘與分析(網(wǎng)絡(luò))研討會(huì)11月線上 已截止報(bào)名
        推薦參加:

        課程時(shí)間: 2020-11-20 08:00至 2020-11-22 18:00結(jié)束

        課程地點(diǎn): 線上活動(dòng) 

        主辦單位: 醫(yī)藥加科研培訓(xùn)中心 上海遐永醫(yī)藥科技 上海遐錦生物科技有限公司

        行業(yè)熱銷熱門關(guān)注看了又看 換一換

              會(huì)議介紹

              會(huì)議內(nèi)容 主辦方介紹


              多組學(xué)數(shù)據(jù)整合挖掘與分析(網(wǎng)絡(luò))研討會(huì)11月線上

              多組學(xué)數(shù)據(jù)整合挖掘與分析(網(wǎng)絡(luò))研討會(huì)11月線上宣傳圖

              ?組學(xué)數(shù)據(jù)整合挖掘與分析(網(wǎng)絡(luò))研討會(huì)

              醫(yī)藥加ZOOM網(wǎng)絡(luò)會(huì)議室?? 20201120-22日(兩天兩晚)

              【背景介紹】

              2019年度國(guó)家自然基金醫(yī)學(xué)科學(xué)部共批資助10138項(xiàng)目,批助金額總計(jì)441310萬元。這些項(xiàng)目中大部分都與編碼基因有直接或間接的關(guān)聯(lián)。其中,與通路(pathway)關(guān)聯(lián)的有1349項(xiàng),金額4.89億;與miRNA相關(guān)的有630項(xiàng),金額2.3億;與lncRNA相關(guān)的有395項(xiàng),金額1.45億,與甲基化相關(guān)的有213項(xiàng),金額8748萬,與突變相關(guān)的有190項(xiàng),金額7410萬;?

              如何獲得有創(chuàng)新意義的疾病靶標(biāo)基因(mRNA,Protein,lncRNA,circRNA,miRNA,Mutation等)是項(xiàng)目申請(qǐng)及文章寫作時(shí)最常見的問題。

              目前,多組學(xué)整合分析是一個(gè)非常熱門且創(chuàng)新的方向。通過多組學(xué)整合分析我們可以更加快速、準(zhǔn)確的找到與研究方向關(guān)聯(lián)的biomarks。它的核心原理是期望通過高通量數(shù)據(jù),找到所有基因在不同組學(xué)水平中的變化并進(jìn)行分析,獲得關(guān)鍵基因在各個(gè)組學(xué)都有顯著作用。

              多組學(xué)整合分析的原始數(shù)據(jù)來源有兩種:(1)自己采集樣本做高通量測(cè)序/芯片/質(zhì)譜等;(2)使用公共數(shù)據(jù)庫中的組學(xué)數(shù)據(jù)(比如TCGA、GEO、EBI、SRA、CGGA、PRIDE等)。

              主要內(nèi)容詳細(xì)內(nèi)容見下文日程表

              1.多組學(xué)分析常用數(shù)據(jù)庫;

              2.多組學(xué)分析常用軟件和工具;

              3.教授對(duì)應(yīng)的圖片制作方法(包含但不限于聚類熱圖、火山圖、富集分析圖、Venn圖、pathwaymap)

              【會(huì)議預(yù)期】

              通過三天的學(xué)習(xí),了解多組學(xué)整合分析思路對(duì)項(xiàng)目及文章的幫助,以及實(shí)操常見的數(shù)據(jù)庫、在線工具和本地軟件。使得學(xué)員可以自己完成一個(gè)完整的分析報(bào)告并獲得疾病相關(guān)的靶標(biāo)基因。

              講師簡(jiǎn)介

              宋偉博士

              成果:參與完成了近百篇軟件著作權(quán)和發(fā)明專利的撰寫和申請(qǐng);肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等數(shù)據(jù)庫的分析和構(gòu)建;完成個(gè)體基因檢測(cè)流程和無創(chuàng)唐篩流程的開發(fā)。

              研究方向:有近十年的生信分析經(jīng)驗(yàn),擅長(zhǎng)方向有轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析、芯片數(shù)據(jù)分析、疾病機(jī)理研究分析、疾病預(yù)后與基因關(guān)聯(lián)分析、項(xiàng)目分析思路設(shè)計(jì)以及個(gè)性化分析等,精通perl、R等編程語言。

              培訓(xùn)經(jīng)歷:在上海、北京、廣州、沈陽、南京等城市舉辦過幾十場(chǎng)培訓(xùn)班。



              主辦方:上海循掘生物科技中心

              會(huì)議時(shí)間?

              2020年11月20-22日(兩天兩晚)

              20日 19:00-20:00

              21日 8:30-18:00 及19:00-20:00

              22日 8:30-17:30

              會(huì)議地點(diǎn)醫(yī)藥加ZOOM網(wǎng)絡(luò)會(huì)議室

              說明研討會(huì)使用專業(yè)會(huì)議軟件ZOOM,需提前安裝好

              查看更多

              醫(yī)藥加科研培訓(xùn)中心 醫(yī)藥加科研培訓(xùn)中心

              舉辦了2018腸道菌群與代謝組學(xué)國(guó)自然課題設(shè)計(jì)及研究策略專題會(huì)議(12月北京班) 2019臨床預(yù)測(cè)模型構(gòu)建與基于R語言統(tǒng)計(jì)分析學(xué)習(xí)班(01.05-01.06北京班) 2019全國(guó)循證醫(yī)學(xué)Meta分析及網(wǎng)狀Meta三天精講學(xué)習(xí)班(1月北京班) 第10期測(cè)序與芯片高通量數(shù)據(jù)挖掘與分析學(xué)習(xí)班2019(1月上海班) 2019腸道菌群與代謝組學(xué)國(guó)自然課題設(shè)計(jì)及研究策略專題會(huì)議(1月上海班) 2019國(guó)自然基金標(biāo)書構(gòu)思與撰寫學(xué)習(xí)班(1月上海班) TCGA,GEO生信高通量數(shù)據(jù)挖掘?qū)n}學(xué)習(xí)班2019(1月上海班) 第8期醫(yī)學(xué)SCI論文寫作及發(fā)表技巧學(xué)習(xí)班2019(1月上海班) ......

              上海遐永醫(yī)藥科技

              南京巴傲得生物科技有限公司(Biogottechnology,co,Ltd),是專一服務(wù)于生命科學(xué)研究的專業(yè)技術(shù)型企業(yè)。是一大批志同道合的資深專業(yè)人士共同創(chuàng)辦的具有現(xiàn)代化經(jīng)營(yíng)管理水平的生物高科技企業(yè),從事生物技術(shù)產(chǎn)品的開發(fā)及銷售,致力于將巴傲得生物打造成中國(guó)乃至世界一流的生物技術(shù)產(chǎn)品供應(yīng)商。巴傲得生物長(zhǎng)期備有Bioworld抗體現(xiàn)貨4000多種抗體可以在一周左右送到客戶的手里。精湛品質(zhì)、合理價(jià)格、專業(yè)服務(wù),是我們?yōu)槟?wù)的宗旨。在細(xì)胞信號(hào)通路、免疫學(xué)、蛋白組學(xué)上擁有顯著優(yōu)勢(shì),其抗體產(chǎn)品、生長(zhǎng)因子等為生命科學(xué)科研工作者提供了極大的便利。

              上海遐錦生物科技有限公司 上海遐錦生物科技有限公司

              上海遐錦生物科技有限公司于2019年11月29日舉辦全國(guó)循證醫(yī)學(xué)Meta分析與網(wǎng)狀Meta研討會(huì)2019(11月上海班)會(huì)議。

              會(huì)議日程 (最終日程以會(huì)議現(xiàn)場(chǎng)為準(zhǔn))


              ?【會(huì)議日程】

              日期

              時(shí)間

              大綱

              詳細(xì)內(nèi)容

              第一天晚上

              19:00-21:00

              第1節(jié):組學(xué)簡(jiǎn)介及生信概述

              2019年國(guó)自然中組學(xué)相關(guān)項(xiàng)目解讀

              組學(xué)原始數(shù)據(jù)的來源及質(zhì)量判斷

              高通量:測(cè)序及芯片介紹——不同組學(xué):轉(zhuǎn)錄組學(xué)、基因組學(xué)、表觀組學(xué)、順反組學(xué)、宏基因組學(xué)等。

              文獻(xiàn)案例解讀

              21:00-22:00

              第2節(jié):軟件安裝

              R包安裝

              R簡(jiǎn)介及R包安裝

              R基礎(chǔ)講解

              R函數(shù)

              R包


              第二天及晚上

              8:30- 10:30

              第3節(jié):組學(xué)公共數(shù)據(jù)庫

              TCGA數(shù)據(jù)庫:最全的癌癥高通量數(shù)據(jù)公共庫(簡(jiǎn)介)及數(shù)據(jù)下載

              GEO數(shù)據(jù)庫的高通量數(shù)據(jù)查找、篩選、數(shù)據(jù)下載

              EBI數(shù)據(jù)庫的高通量數(shù)據(jù)查找、篩選、數(shù)據(jù)下載

              GEO2R工具使用

              10:30-10:45

              休息

              10:45-12:00


              第4節(jié):轉(zhuǎn)錄組差異基因篩選及功能富集分析

              計(jì)算差異基因 -R limma包 或Excel公式

              主成分分析(PCA)圖制作

              聚類熱圖(heatmap)的制作——R pheatmap包

              火山圖(volcanoPlot)——R ggplot2包 或 Excel制作

              箱式圖(代碼 或無代碼制作)

              R clusterProfiler包富集分析

              基因/蛋白功能富集分析——DAVID工具

              功能富集分析 柱狀圖、條形圖、氣泡圖、餅狀圖的R代碼及Excel制作

              12:00-13:30

              午餐及午休

              13:30-17:30

              第5節(jié):多組學(xué)數(shù)據(jù)與臨床預(yù)后分析

              基因突變分析工具——cbioportal

              在線預(yù)后分析工具——Ualcan

              本地生成KM曲線圖——R survival包

              相關(guān)性分析及散點(diǎn)圖制作

              17:30-19:00

              晚餐

              19:00-22:00

              第6節(jié):轉(zhuǎn)錄組與蛋白組整合分析

              Venn 圖制作

              蛋白與蛋白互作關(guān)系預(yù)測(cè)——STRING工具

              網(wǎng)絡(luò)圖構(gòu)建與美化——cytoscape軟件

              轉(zhuǎn)錄組與蛋白組整合關(guān)聯(lián)分析思路文章實(shí)現(xiàn)


              第三天

              8:30-10:00

              第7節(jié):蛋白組與代謝組整合分析

              代謝物功能富集分析——metaboanalyst工具

              KEGG 數(shù)據(jù)庫介紹及使用

              pathway map制作

              蛋白組與代謝組整合分析思路文章實(shí)現(xiàn)

              10:00-10:15

              休息

              10:15-12:00

              第8節(jié):全轉(zhuǎn)錄組整合分析

              各類RNA簡(jiǎn)介及ceRNA介紹

              miRNA測(cè)序報(bào)告解讀

              circRNA測(cè)序報(bào)告解讀

              miRNA分析工具

              lncRNA分析工具

              12:00-13:30

              午餐及午休

              13:30-15:30

              第9節(jié):其他組學(xué)整合思路

              腸道菌群宏基因組與代謝組

              表觀組與轉(zhuǎn)錄組整合

              15:30-15:45

              休息

              15:45-16:00

              總結(jié)

              總結(jié)及答疑

              ?

              通過本次研討會(huì),您將學(xué)會(huì)以下作圖:

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              會(huì)議嘉賓


              即將更新,敬請(qǐng)期待

              參會(huì)指南

              會(huì)議門票


              收費(fèi)標(biāo)準(zhǔn):會(huì)務(wù)費(fèi):3200元/人

              優(yōu)惠政策:

              1.提前確認(rèn)報(bào)名及轉(zhuǎn)賬的,可以提前拿到學(xué)習(xí)材料

              2.三人組團(tuán)報(bào)名,每人優(yōu)惠100元

              3.四人組團(tuán)報(bào)名,每人優(yōu)惠200元,

              4.六人組團(tuán)報(bào)名繳費(fèi),可免1人會(huì)務(wù)費(fèi)!?

              可以開正規(guī)會(huì)務(wù)發(fā)票,紙質(zhì)邀請(qǐng)函(蓋紅章)。?

              注意事項(xiàng):必須攜帶win10以上系統(tǒng)的電腦,現(xiàn)場(chǎng)不得錄音錄像。上課軟件為Cytoscape,Heml,GSEA,R和Rstudio。

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              查看更多

              溫馨提示
              酒店與住宿: 為防止極端情況下活動(dòng)延期或取消,建議“異地客戶”與活動(dòng)家客服確認(rèn)參會(huì)信息后,再安排出行與住宿。
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