“實用生物信息學”研討班
時間：2015-08-24 08:00 至 2015-08-28 18:00
地點：北京
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“實用生物信息學”研討班 已截止報名會議時間： 2015-08-24 08:00至 2015-08-28 18:00結(jié)束 |
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會議通知
如您所知，近年來，以基因組科學為代表的研究工作和技術平臺先后獲得各項資助，如國家863計劃、973計劃、中國科學院知識創(chuàng)新工程、國家重大攻關項目、自然科學基金等。為了輔助廣大科研工作者掌握高通量測序技術原理、實驗設計以及后期數(shù)據(jù)分析技能，北京市計算中心生物計算事業(yè)部與軍事醫(yī)學科學院微生物流行病研究所生物信息學研究室聯(lián)合舉辦“實用生物信息學”培訓研習班。
“實用生物信息學”研討班
培訓亮點
1、授課教師：來自首師大、蛋白質(zhì)中心、計算中心、軍科院，多個海歸博士，均在生物信息學領域有豐富的工作經(jīng)驗。
2、實際實用：理論講授和上機實習搭配，結(jié)合具體案例。
3、精致小班：每班少于35人，可根據(jù)學員課前提出的工作需求調(diào)整課程內(nèi)容。
4、VIP待遇：培訓后，仍可免費來我中心與生物信息專家一對一輔導。
5、效果保障：至今已經(jīng)成功舉辦多次生物信息分析專題培訓，累計百余人次，廣受學員好評。
主辦單位
北京市計算中心、軍事醫(yī)學科學院微生物流行病研究所生物信息學研究室
培訓時間、地點
地點：北京海淀區(qū)豐賢中路7號3號樓，北京市計算中心三層會議室
時間：2015.8.24-2015.8.28 （上午：9:30-12:00下午：13:00-16:30）
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會議日程
（最終日程以會議現(xiàn)場為準）
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日期 |
授課題目 |
授課內(nèi)容 |
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第一天 |
生物信息學導論 |
1．生物信息學發(fā)展簡史（重點講解） 2．生物信息學主要研究領域（重點講解） 3．生物信息學軟件和工具 4．生物信息學重要會議 |
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生物信息學基礎（上機操作） |
1、linux基礎 掌握Linux系統(tǒng)下的常用命令(重點) 掌握linux環(huán)境下軟件的安裝使用 了解shell腳本的編寫 2、perl基礎 介紹Perl 的基本元素 Perl在生物信息中應用示例(DNA復制、DNA轉(zhuǎn)錄、RNA翻譯) |
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第二天 |
二代測序技術原理及基因組拼接 |
1、介紹目前主流二代測序儀的測序原理 2、主要操作流程及特點 3、序列拼接的技術方法 4、常用軟件及全基因組個性化組裝的技巧 |
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基因組拼接組裝（以細菌/病毒為例）（上機操作） |
1、全基因組組裝的流程介紹 2、原始測序數(shù)據(jù)的預處理 3、分別介紹Velvet和SOAPdenovo的使用，并以一株細菌的測序數(shù)據(jù)為例進行組裝 4、介紹Newbler的是使用，并以一個IonTorrent測序的噬菌體數(shù)據(jù)為例進行組裝 5、以細菌的數(shù)據(jù)為例,介紹填補gap的方法，包括延伸法，局部拼接法 |
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第三天 |
基因組重測序與數(shù)據(jù)分析 |
1、講解基因組重測序的概念、目的與應用 2、結(jié)合實例講解其原理、類據(jù)類型與格式、操作流程、軟件等相關知識 |
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基因組重測序數(shù)據(jù)分析實例（上機操作） |
1、對二代測序數(shù)據(jù)的解讀 2、數(shù)據(jù)質(zhì)量控制及數(shù)據(jù)過濾 3、使用BWA和Samtools進行數(shù)據(jù)比對并對比對結(jié)果進行可視化（重點講解） 4、尋找SNP和Indel并進行注釋（重點講解） 5、尋找結(jié)構(gòu)變異并對變異進行注釋（重點講解） |
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第四天 |
轉(zhuǎn)錄組測序與數(shù)據(jù)分析 |
1、轉(zhuǎn)錄組基本概況和技術發(fā)展簡介 2、轉(zhuǎn)錄組技術流程及技術細節(jié)（重點講解） 3、轉(zhuǎn)錄組應用案例 |
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轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析實例（上機操作） |
1、轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)準備和軟件介紹及安裝 2、轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的比對（重點講解） 3、表達量估計和分析（重點講解） 4、后續(xù)功能分析簡介 |
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第五天 |
microRNA測序與數(shù)據(jù)分析 |
1、microRNA目前的應用、發(fā)展歷史以及microRNA的定義 2、microRNA的生物學過程（重點講解） 3、microRNA的測序（重點講解） 4、microRNA測序數(shù)據(jù)分析軟件（重點講解） 5、microRNA目前的挑戰(zhàn)以及將來的研究前景 6、microRNA測序數(shù)據(jù)分析案例展示（重點講解） 7、近期文獻 |
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microRNA數(shù)據(jù)分析實例（上機操作） |
1、microRNA測序數(shù)據(jù)預處理（重點講解） 2、測序數(shù)據(jù)長度分布計算 3、microRNA的預測（重點講解） 4、microRNA堿基偏好性計算 5、microRNA靶標基因預測，結(jié)果提取、統(tǒng)計（重點講解） |
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蛋白質(zhì)組信息學平臺及應用 |
1、蛋白質(zhì)鑒定的質(zhì)量控制 2、非限制性蛋白質(zhì)翻譯后修飾鑒定 3、蛋白質(zhì)定量分析 4、蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)管理 5、案例分析 |
?(課程內(nèi)容以實際授課為準)
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會議嘉賓
會議門票
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報名種類 |
優(yōu)惠對象 |
注冊費①/折扣 |
贈送計算資源包月套餐② |
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A |
在校學生（需學生證） |
4950元/9折 |
1個月（價值3.5萬元）+終身VIP會員③ |
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B |
工作人員 |
5500元 |
2個月（價值7萬元）+終身VIP會員 |
①?? 注冊費含聽課費、資料費、上機費和午餐。請自帶筆記本電腦用以上機實習。
②?? 資源數(shù)量含16核、32G內(nèi)存、100G存儲空間, 有效期自培訓結(jié)束后生效，有效期6個月。
③?? 所有學員自動成為VIP會員，永久享受生物計算分析服務9折優(yōu)惠。
報名優(yōu)惠政策
1、3人以上團體報名每人可減少400元；
2、4+1團報，可免費贈送一個名額?????????????? ?
3、上面3種優(yōu)惠政策不能同時享受，只能享受其中一種。
培訓以收到學員培訓費為成功報名，培訓座位按收到費用先后順序安排。
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會議場地：北京市計算中心
介紹：北京市計算中心建立于一九七三年，是國內(nèi)最早一批計算中心之一，是中國最早、最具影響力的從事計算機應用技術研究及推廣的機構(gòu)，服務對象則涉及工業(yè)、商業(yè)、交通、能源、環(huán)保金融、稅務、社會事務等多個領域。北京市計算中心自成立以來，完成了上百項國家和北京市政府有關部門委托的研究項目和面向多種用戶的服務型項目。先后獲得國家及省部級成果獎30多項、，擁有了200余項國際國內(nèi)領先的技術和產(chǎn)品，為中國計算機的普及、應用和發(fā)展做出了杰出貢獻
溫馨提示
酒店與住宿:
為防止極端情況下活動延期或取消，建議“異地客戶”與活動家客服確認參會信息后，再安排出行與住宿。
退款規(guī)則:
活動各項資源需提前采購，購票后不支持退款，可以換人參加。
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