siesta?課程主題

siesta?課程內(nèi)容

一、密度泛函理論(DFT)及相關(guān)軟
件介紹

1.DFT?密度泛函理論基本原理方法
2.Hohenberg-Kohn?定理
3.Kohn-Sham?方程
4.DFT理論在材料模擬中的應(yīng)用

二、?Linux，?MS?基礎(chǔ)以及?Linux
系統(tǒng)軟件安裝

1. Linux?基本操作：

??文件復(fù)制，移動，重命名，比較， 任務(wù)提交，刪除
2．Material Studio?結(jié)構(gòu)模型創(chuàng)建
3．常見軟件在?Linux下的編譯和安裝

4.?常見任務(wù)管理系統(tǒng)介紹，以及隊列系統(tǒng)中任務(wù)的提交管理

三、?siesta?基本原理及其贗勢
和基組

1．siesta?程序介紹，安裝及簡單例子運(yùn)行測試
2. siesta?贗勢設(shè)置
3. siesta?基組設(shè)置
4. siesta?輸入文件?fdf?設(shè)置
5. siesta?實(shí)際例子（Si?晶體和?H2O?分子）計算

四、?siesta?常見計算參數(shù)設(shè)置

1.結(jié)構(gòu)優(yōu)化、能量和性質(zhì)計算流程；
輸入和輸出文件內(nèi)容的講解；
關(guān)鍵詞的使用方法；
斷點(diǎn)重啟、計算結(jié)構(gòu)可視化。
2.泛函的選擇、自旋極化設(shè)置、?K-points?設(shè)置、 布里淵區(qū)路徑設(shè)置、
并行運(yùn)行方法、基組的選擇、軌道截斷半徑設(shè)置等
3.重要參數(shù)的原理、設(shè)置技巧、使用注意事項(xiàng)；
常見問題的處理方法；
關(guān)鍵字的設(shè)置和應(yīng)用方法；
高精度計算的案例操作。

五、 高級建模以及?siesta應(yīng)用實(shí)例

1.?納米量子點(diǎn)結(jié)構(gòu)模擬分析 （Si?納米團(tuán)簇， 單分子計算）
2.?一維納米條帶,納米線結(jié)構(gòu)搭建；缺陷、摻雜體系分析等
（armchair?和?zigzag?納米管以及?stone-wall?缺陷）

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3.?二維納米平面結(jié)構(gòu)，石墨烯計算????

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4.?材料晶格動力學(xué)分析計算 （Si?動力學(xué)穩(wěn)定）
5.?基于第一性原理分子動力學(xué)計算判斷材料穩(wěn)定性 （晶體?MD?分析）
6.?材料力學(xué)性能計算 （體相材料彈性常數(shù)和斷裂分析）

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7. 磁性材料計算模擬 （氫化石墨烯條帶磁性分析）
8.三維體相能帶結(jié)構(gòu)及其態(tài)密度分布計算（晶體?band?和?dos?計算）

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9.?光學(xué)性質(zhì)計算 （平面氮化硼和立方氮化硼的對比分析）

10.表面模型搭建，表面吸附模型等（二維石材料吸附計算）

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11.?高通量計算，機(jī)器學(xué)習(xí)和pymatgen軟件簡介

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六、課堂互動及答疑

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1.分組討論
2.專題技術(shù)討論
3.課后技術(shù)指導(dǎo)
4.綜合計算練習(xí)

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