2018測序與芯片高通量數據挖掘與分析學習班(9月南京班)
時間:2018-09-29 08:00 至 2018-09-30 18:00
地點:南京

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首頁 > 商務會議 > 醫(yī)療醫(yī)學會議 > 2018測序與芯片高通量數據挖掘與分析學習班(9月南京班) 更新時間:2018-07-09T17:23:21
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![]() 2018測序與芯片高通量數據挖掘與分析學習班(9月南京班) 已截止報名會議時間: 2018-09-29 08:00至 2018-09-30 18:00結束 會議規(guī)模:50人 主辦單位: 上海遐永醫(yī)藥科技
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會議介紹
會議內容 主辦方介紹

2018測序與芯片高通量數據挖掘與分析學習班(9月南京班)宣傳圖
生物信息學(bioinformatics)定義:是在大分子方面的概念型的生物學,并且使用了信息學的技術,這包括了從應用數學、計算機科學以及統(tǒng)計學等學科衍生而來各種方法,并以此在大尺度上來理解和組織與生物大分子相關的信息。
生物信息學魅力:
幫助預測疾病相關的潛在基因,以及該基因潛在的作用靶點、上游調控轉錄因子等,從而指導實驗方向、縮小試驗范圍、簡化試驗流程。
為基金申請?zhí)峁┲С郑ㄟ^強大的信息數據的收集整理,減少投入增強研究目的性;且通過整合技術優(yōu)勢,指導提高臨床診斷水平。
豐富的免費的數據資源和生物軟件工具:數據庫:NCBI, EBI, DDBJ, PDB,SWISS-PROT等;軟件工具:Cytoscape,BLAST,? R語言,String,? David等。
本次培訓目的:
很多老師都做過測序或者芯片實驗,雖然測序公司已經給出了一部分的數據分析,比如過濾、質控、比對、定量和差異等,但是這些分析屬于基礎傻瓜式的標準分析,并不能完整的講一個故事!因此,需要我們自己掌握高通量數據挖掘的能力,從海量信息中獲得自己想要的關鍵基因!
培訓預期:
通過2天的培訓,使學員掌握生信文獻分析思路和8個實用操作知識點(具體見最后),可以獨立完成一篇基于公共數據庫的高通量數據挖掘分析。
通過2天的學習,我們可以掌握一篇生信SCI文獻的所有分析模塊,并可以獨立的結合自己的研究方向進行生信分析和數據挖掘,獲得一套屬于自己的分析結果。
學習班時間與地點(上海班)
上海班 ??培訓時間:2018年5月26-27日?、8月4-5日、11月17-18日
培訓地點:?上海好望角大飯店?? 上海市肇嘉浜路500號
北京班 ?培訓時間:2018年7月14-15日、9月15-16日
培訓地點:北京金泰綠洲大酒店 ?北京市東城區(qū)永外彭莊甲58號
廣州班 ?培訓時間:8月18-19日
培訓地點:廣州凱榮都國際大酒店 廣州市海珠區(qū)江海大道3號
南京班:培訓時間:9月29-30日
深圳班:培訓時間:12月29-30日
學習辦主辦:醫(yī)藥加學習班
學習班承辦方:上海遐永醫(yī)藥科技
學習班贊助方:爾云生信
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南京巴傲得生物科技有限公司(Biogottechnology,co,Ltd),是專一服務于生命科學研究的專業(yè)技術型企業(yè)。是一大批志同道合的資深專業(yè)人士共同創(chuàng)辦的具有現代化經營管理水平的生物高科技企業(yè),從事生物技術產品的開發(fā)及銷售,致力于將巴傲得生物打造成中國乃至世界一流的生物技術產品供應商。巴傲得生物長期備有Bioworld抗體現貨4000多種抗體可以在一周左右送到客戶的手里。精湛品質、合理價格、專業(yè)服務,是我們?yōu)槟盏淖谥?。在細胞信號通路、免疫學、蛋白組學上擁有顯著優(yōu)勢,其抗體產品、生長因子等為生命科學科研工作者提供了極大的便利。
會議日程
(最終日程以會議現場為準)
第一天上午第一節(jié):基因數據庫使用介紹
測序標準報告的解讀。
NCBI Gene數據庫:最權威的基因綜合數據庫之一。
NCBI GEO數據庫:數據量最大的高通量公共數據庫。
GEO2R工具:在線做差異分析的R工具
bioDBnet:在線基因ID轉換工具。
Uniprot:最權威的蛋白綜合數據庫之一。
第一天上午第二節(jié):?DAVID工具——功能富集分析
?????????功能富集的原理和意義
基因ID轉換
?????????基因功能注釋(GO?,KEGG pathway)
?????????基因功能富集(GO?,KEGG pathway)
?????????基因功能聚類(GO?,KEGG pathway)
????????
第一天下午第三節(jié)?聚類熱圖及pathwaymap圖
KEGG?數據庫:最權威的通路數據庫(pathway map?分析)
HEMI軟件:構建聚類熱圖的本地軟件
第一天下午第四節(jié). STRING工具——基因/蛋白相互作用分析(PPI)
?????????蛋白互作分析的原理和意義;
?????????單個蛋白的蛋白互作分析;
?????????多個蛋白的蛋白互作分析;
???????? STRING工具的使用步驟:輸入、參數設置、輸出等。
第二天上午第五節(jié)?cytoscape網絡做圖軟件(上)
?????????網絡圖構建
?????????逐個修改節(jié)點的屬性和修改邊的屬性
?????????網絡展示方式layout更美觀
?????????網絡統(tǒng)計分析
????????
第二天下午第六節(jié)? cytoscape網絡做圖軟件(下)
?????????批量修改節(jié)點的屬性和修改邊的屬性
???????? Cytoscape的常用插件:ClusterONE
???????? Cytoscape的常用插件:BinGO
第二天下午第七節(jié)??答疑環(huán)節(jié)
通過該主題的學習,可以學會:
高通量公共數據的詳細信息查找/下載;
在線做差異表達分析
在線blast分析
基因ID轉換
通路map圖制作
功能富集分析
蛋白互作分析
網絡圖的構建和美化。
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會議嘉賓
(最終出席嘉賓以會議現場為準)
講師簡介:
宋博士
成果:參與完成了近百篇軟件著作權和發(fā)明專利的撰寫和申請;肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等數據庫的分析和構建;完成個體基因檢測流程和無創(chuàng)唐篩流程的開發(fā)。
研究方向:有近十年的生信分析經驗,擅長方向有轉錄組測序分析、芯片數據分析、疾病機理研究分析、疾病預后與基因關聯分析、項目分析思路設計以及個性化分析等,精通perl、R等編程語言。
培訓經歷:在上海、沈陽、濟南、武漢等城市舉辦過十幾場培訓班。培訓的對象有:醫(yī)生、學生、科研工作者、生信愛好者等。
培訓方向:《測序與芯片數據分析》、《生物信息學的魅力》、《生信文章實例解讀》、《生信與實驗的密切關系》、《生信與臨床醫(yī)學的關系》、《生信實用工具培訓》、《多組學整合分析流程》、《R語言培訓》等
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參會指南
會議門票
?注冊費:2500元每位(注冊費包含電子版教材、午餐,住宿費自理。)
優(yōu)惠政策:
1.?提前確認報名及轉賬的,可以提前拿到學習材料
2.?三人組團報名,每人可優(yōu)惠100元
3.?四人組團報名,每人收費2300元,
4. ?五人組團報名繳費,額外帶一人免費注冊!
可以開正規(guī)會務發(fā)票,紙質邀請函(蓋紅章)。
特別說明:如果需要學習班的上外網路由神器,用于上google學術等國外網站,請自己在邀請函上加900元,我們會在你們的會務費發(fā)票上加900元,給您開發(fā)票,如果不需要神器,就是按照我們邀請函上的價格,神器可以至少保證用2年以后。
廣州班 ?08.18-08.19???????
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溫馨提示
酒店與住宿:
為防止極端情況下活動延期或取消,建議“異地客戶”與活動家客服確認參會信息后,再安排出行與住宿。
退款規(guī)則:
活動各項資源需提前采購,購票后不支持退款,可以換人參加。
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