2018生信高通量數(shù)據(jù)挖掘與分析學(xué)習(xí)班(理論+實(shí)踐課)
時(shí)間:2018-11-17 08:00 至 2018-11-18 18:00
地點(diǎn):廣州

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![]() 2018生信高通量數(shù)據(jù)挖掘與分析學(xué)習(xí)班(理論+實(shí)踐課) 已截止報(bào)名會(huì)議時(shí)間: 2018-11-17 08:00至 2018-11-18 18:00結(jié)束 會(huì)議地點(diǎn): 廣州 廣州南洋長(zhǎng)勝酒店 廣州市天河區(qū)興華路38號(hào) 周邊酒店預(yù)訂 主辦單位: 上海遐永醫(yī)藥科技
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會(huì)議介紹
會(huì)議內(nèi)容 主辦方介紹

2018生信高通量數(shù)據(jù)挖掘與分析學(xué)習(xí)班(理論+實(shí)踐課)宣傳圖
2018/11/17-18 (16號(hào)報(bào)到)廣州南洋長(zhǎng)勝酒店
學(xué)習(xí)班簡(jiǎn)介
高通量數(shù)據(jù)挖掘與分析是基于生信的方法從芯片及測(cè)序高通量數(shù)據(jù)中挖掘到與研究方向最相關(guān)的靶標(biāo)基因(mRNA,miRNA,lncRNA或蛋白)。隨著高通量手段的不斷進(jìn)步,測(cè)序和芯片的成本也逐漸降低,速度也越來(lái)越快,使用高通量手段(測(cè)序/芯片)進(jìn)行科研的優(yōu)點(diǎn)非常明顯,也是大勢(shì)所趨!?
做過(guò)測(cè)序或者芯片實(shí)驗(yàn)的科研人員越來(lái)越多,雖然測(cè)序公司已經(jīng)給出了一部分的數(shù)據(jù)分析,比如過(guò)濾、質(zhì)控比對(duì)、定量和差異等,但是這些分析屬于基礎(chǔ)傻瓜式的標(biāo)準(zhǔn)分析,并不能完整的講一個(gè)故事!我們也很難在大量的差異基因中篩選獲得關(guān)鍵基因。因此,需要我們自己掌握高通量數(shù)據(jù)挖掘的能力,從海量信息中獲得自己想要的關(guān)鍵基因!
培訓(xùn)目的:
很多學(xué)員都做過(guò)測(cè)序或者芯片實(shí)驗(yàn),雖然測(cè)序公司已經(jīng)給出了一部分的數(shù)據(jù)分析,比如過(guò)濾、質(zhì)控、比對(duì)、定量和差異等,但是這些分析屬于基礎(chǔ)傻瓜式的標(biāo)準(zhǔn)分析,并不能完整的講一個(gè)故事!因此,需要我們自己掌握高通量數(shù)據(jù)挖掘的能力,從海量信息中獲得自己想要的關(guān)鍵基因!
培訓(xùn)預(yù)期:
通過(guò)2天的培訓(xùn)(半天理論課程+1天半實(shí)踐操作),使學(xué)員掌握生信文獻(xiàn)分析思路和8個(gè)實(shí)用操作知識(shí)點(diǎn)(具體見(jiàn)最后),可以獨(dú)立完成一篇基于公共數(shù)據(jù)庫(kù)的高通量數(shù)據(jù)挖掘分析,2天培訓(xùn)合格后,頒發(fā)專(zhuān)業(yè)技術(shù)人員繼續(xù)教育培訓(xùn)證書(shū)。
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南京巴傲得生物科技有限公司(Biogottechnology,co,Ltd),是專(zhuān)一服務(wù)于生命科學(xué)研究的專(zhuān)業(yè)技術(shù)型企業(yè)。是一大批志同道合的資深專(zhuān)業(yè)人士共同創(chuàng)辦的具有現(xiàn)代化經(jīng)營(yíng)管理水平的生物高科技企業(yè),從事生物技術(shù)產(chǎn)品的開(kāi)發(fā)及銷(xiāo)售,致力于將巴傲得生物打造成中國(guó)乃至世界一流的生物技術(shù)產(chǎn)品供應(yīng)商。巴傲得生物長(zhǎng)期備有Bioworld抗體現(xiàn)貨4000多種抗體可以在一周左右送到客戶(hù)的手里。精湛品質(zhì)、合理價(jià)格、專(zhuān)業(yè)服務(wù),是我們?yōu)槟?wù)的宗旨。在細(xì)胞信號(hào)通路、免疫學(xué)、蛋白組學(xué)上擁有顯著優(yōu)勢(shì),其抗體產(chǎn)品、生長(zhǎng)因子等為生命科學(xué)科研工作者提供了極大的便利。
會(huì)議日程
(最終日程以會(huì)議現(xiàn)場(chǎng)為準(zhǔn))
課程安排:
第一天上午
1、理論課程:
8.30-10:00第一節(jié):基因數(shù)據(jù)庫(kù)使用介紹
測(cè)序標(biāo)準(zhǔn)報(bào)告的解讀。
NCBI Gene數(shù)據(jù)庫(kù):最權(quán)威的基因綜合數(shù)據(jù)庫(kù)之一。
NCBI GEO數(shù)據(jù)庫(kù): 數(shù)據(jù)量最大的高通量公共數(shù)據(jù)庫(kù)。
GEO2R工具:在線(xiàn)做差異分析的R工具
bioDBnet:在線(xiàn)基因ID轉(zhuǎn)換工具。
Uniprot: 最權(quán)威的蛋白綜合數(shù)據(jù)庫(kù)之一。
10.15-12:00第二節(jié): DAVID工具——功能富集分析
功能富集的原理和意義
基因ID轉(zhuǎn)換
基因功能注釋?zhuān)℅O ,KEGG pathway)
基因功能富集(GO ,KEGG pathway)
基因功能聚類(lèi)(GO ,KEGG pathway)
2、第一天下午
實(shí)踐操作課程(共1天半)
13:30-17:30第三節(jié) 聚類(lèi)熱圖及pathway map圖
KEGG 數(shù)據(jù)庫(kù):最權(quán)威的通路數(shù)據(jù)庫(kù)(pathway map 分析)
HEMI軟件:構(gòu)建聚類(lèi)熱圖的本地軟件
第二天
8:30-10:00第四節(jié). STRING工具——基因/蛋白相互作用分析(PPI)
蛋白互作分析的原理和意義;
單個(gè)蛋白的蛋白互作分析;
多個(gè)蛋白的蛋白互作分析;
STRING工具的使用步驟:輸入、參數(shù)設(shè)置、輸出等。
10:15-12:00第五節(jié) cytoscape網(wǎng)絡(luò)做圖軟件(上)
網(wǎng)絡(luò)圖構(gòu)建
逐個(gè)修改節(jié)點(diǎn)的屬性和修改邊的屬性
網(wǎng)絡(luò)展示方式layout更美觀
網(wǎng)絡(luò)統(tǒng)計(jì)分析
13:30-15:30第六節(jié) ?cytoscape網(wǎng)絡(luò)做圖軟件(下)
批量修改節(jié)點(diǎn)的屬性和修改邊的屬性
Cytoscape的常用插件:ClusterONE
Cytoscape的常用插件:BinGO
15:30-17:00 ?答疑環(huán)節(jié)
通過(guò)該主題的學(xué)習(xí),可以學(xué)會(huì):
高通量公共數(shù)據(jù)的詳細(xì)信息查找/下載;
在線(xiàn)做差異表達(dá)分析
在線(xiàn)blast分析
基因ID轉(zhuǎn)換
通路map圖制作
功能富集分析
蛋白互作分析
網(wǎng)絡(luò)圖的構(gòu)建和美化。
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會(huì)議嘉賓
(最終出席嘉賓以會(huì)議現(xiàn)場(chǎng)為準(zhǔn))
講師簡(jiǎn)介
宋偉 博士
成果:參與完成了近百篇軟件著作權(quán)和發(fā)明專(zhuān)利的撰寫(xiě)和申請(qǐng);肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等數(shù)據(jù)庫(kù)的分析和構(gòu)建;完成個(gè)體基因檢測(cè)流程和無(wú)創(chuàng)唐篩流程的開(kāi)發(fā)。
研究方向:有近十年的生信分析經(jīng)驗(yàn),擅長(zhǎng)方向有轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析、芯片數(shù)據(jù)分析、疾病機(jī)理研究分析、疾病預(yù)后與基因關(guān)聯(lián)分析、項(xiàng)目分析思路設(shè)計(jì)以及個(gè)性化分析等,精通perl、R等編程語(yǔ)言。
培訓(xùn)經(jīng)歷:在上海、沈陽(yáng)、濟(jì)南、武漢等城市舉辦過(guò)十幾場(chǎng)培訓(xùn)班。培訓(xùn)的對(duì)象有:醫(yī)生、學(xué)生、科研工作者、生信愛(ài)好者等。
培訓(xùn)方向:《測(cè)序與芯片數(shù)據(jù)分析》、《生物信息學(xué)的魅力》、《生信文章實(shí)例解讀》、《生信與實(shí)驗(yàn)的密切關(guān)系》、《生信與臨床醫(yī)學(xué)的關(guān)系》、《生信實(shí)用工具培訓(xùn)》、《多組學(xué)整合分析流程》、《R語(yǔ)言培訓(xùn)》等
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參會(huì)指南
會(huì)議門(mén)票 場(chǎng)館介紹
學(xué)習(xí)費(fèi)2500元每位(學(xué)習(xí)費(fèi)包含電子版教材、午餐,住宿費(fèi)自理,第二次復(fù)聽(tīng)的學(xué)員只要付500元,保證學(xué)員完全掌握。)
可以開(kāi)正規(guī)會(huì)務(wù)發(fā)票,紙質(zhì)邀請(qǐng)函(蓋紅章)。?
注意事項(xiàng):攜帶windows系統(tǒng)的電腦,蘋(píng)果電腦請(qǐng)務(wù)必提前做好雙系統(tǒng)?,F(xiàn)場(chǎng)不得錄音錄像。
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廣東南洋長(zhǎng)勝酒店位于廣州市天河區(qū)中心,面向風(fēng)光秀麗景色迷人的白云山,由南洋長(zhǎng)勝酒店有限公司投資興建,總投資6億多人民幣。
酒店采用法國(guó)凡爾賽藝術(shù)風(fēng)格,宮殿式大堂流光溢彩,極盡繁華尊貴。酒店?duì)I業(yè)面積4萬(wàn)多平方米,客房淡雅高貴,國(guó)際互聯(lián)網(wǎng)、電腦、大屏幕電視等一應(yīng)俱全;部分房間配備進(jìn)口按摩浴缸,為您消除一路的風(fēng)塵和疲勞。
酒店同時(shí)設(shè)有皇廷中餐廳、西餐廳、多功能大型會(huì)議廳、皇廷國(guó)際俱樂(lè)部、健康中心、桌球室、乒乓球室等配套設(shè)施及項(xiàng)目,滿(mǎn)足客人的不同需求,為您提供一站式的貴賓服務(wù)。
溫馨提示
酒店與住宿:
為防止極端情況下活動(dòng)延期或取消,建議“異地客戶(hù)”與活動(dòng)家客服確認(rèn)參會(huì)信息后,再安排出行與住宿。
退款規(guī)則:
活動(dòng)各項(xiàng)資源需提前采購(gòu),購(gòu)票后不支持退款,可以換人參加。
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