TCGA,GEO生信高通量數(shù)據(jù)挖掘?qū)ｎ}學(xué)習(xí)班2018（北京）
時(shí)間：2018-12-15 08:00 至 2018-12-16 18:00
地點(diǎn)：北京
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首頁 > 商務(wù)會議 > 醫(yī)療醫(yī)學(xué)會議 > TCGA,GEO生信高通量數(shù)據(jù)挖掘?qū)ｎ}學(xué)習(xí)班2018（北京） 更新時(shí)間：2019-01-11T14:08:31
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TCGA,GEO生信高通量數(shù)據(jù)挖掘?qū)ｎ}學(xué)習(xí)班2018（北京） 已截止報(bào)名會議時(shí)間： 2018-12-15 08:00至 2018-12-16 18:00結(jié)束 會議地點(diǎn)： 北京 詳細(xì)地址會前通知 周邊酒店預(yù)訂 主辦單位： 上海遐永醫(yī)藥科技 |
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會議介紹
會議內(nèi)容 主辦方介紹
TCGA,GEO生信高通量數(shù)據(jù)挖掘?qū)ｎ}學(xué)習(xí)班2018（北京）宣傳圖
注意事項(xiàng)：攜帶windows系統(tǒng)的電腦，蘋果電腦請務(wù)必提前做好雙系統(tǒng)?，F(xiàn)場不得錄音錄像。
培訓(xùn)簡介：
癌癥是臨床醫(yī)學(xué)中非常重要的疾病方向。TCGA數(shù)據(jù)庫中包含了常見了40種癌癥方向（含30000個(gè)樣本）的高通量數(shù)據(jù)及臨床信息。大家對TCGA數(shù)據(jù)庫的使用近幾年也在逐漸增加！如圖1所示。
圖1 基于 pubmed數(shù)據(jù)庫檢索的包含“TCGA”發(fā)表的SCI 文章數(shù)量（2018年11月7日）
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關(guān)鍵靶標(biāo)分析是指基于生信的方法從高通量數(shù)據(jù)中挖掘到與研究方向最相關(guān)的靶標(biāo)基因（mRNA，miRNA，lncRNA或蛋白）。
因此，需要我們自己掌握高通量數(shù)據(jù)挖掘的能力以及邏輯性的生信分析思路，從海量信息中獲得自己想要的關(guān)鍵基因！
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培訓(xùn)預(yù)期：
1. 通過整整兩天的培訓(xùn)，掌握TCGA，GEO數(shù)據(jù)庫的使用、下載及分析思路和實(shí)用操作知識點(diǎn)。
2. 可以獨(dú)立完成一篇基于公共數(shù)據(jù)庫的高通量數(shù)據(jù)挖掘分析。
3. 課后還可以贈(zèng)送1小時(shí)的全場串聯(lián)視頻，用于學(xué)員的復(fù)習(xí)。
4. 贈(zèng)送一份最近5年的高價(jià)值國自然標(biāo)書（醫(yī)藥加高價(jià)值標(biāo)書庫里面選擇）
5. 講師團(tuán)隊(duì)贈(zèng)送TCGA數(shù)據(jù)庫甲基化，基因表達(dá)譜整合分析報(bào)告與疾病mRNA+lncRNA分析報(bào)告
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學(xué)習(xí)班組織方
主辦方：醫(yī)藥加平臺
承辦方：上海遐永醫(yī)藥科技有限公司
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南京巴傲得生物科技有限公司(Biogottechnology,co,Ltd），是專一服務(wù)于生命科學(xué)研究的專業(yè)技術(shù)型企業(yè)。是一大批志同道合的資深專業(yè)人士共同創(chuàng)辦的具有現(xiàn)代化經(jīng)營管理水平的生物高科技企業(yè)，從事生物技術(shù)產(chǎn)品的開發(fā)及銷售，致力于將巴傲得生物打造成中國乃至世界一流的生物技術(shù)產(chǎn)品供應(yīng)商。巴傲得生物長期備有Bioworld抗體現(xiàn)貨4000多種抗體可以在一周左右送到客戶的手里。精湛品質(zhì)、合理價(jià)格、專業(yè)服務(wù)，是我們?yōu)槟?wù)的宗旨。在細(xì)胞信號通路、免疫學(xué)、蛋白組學(xué)上擁有顯著優(yōu)勢，其抗體產(chǎn)品、生長因子等為生命科學(xué)科研工作者提供了極大的便利。
會議日程
（最終日程以會議現(xiàn)場為準(zhǔn)）
注意事項(xiàng)：攜帶windows系統(tǒng)的電腦，蘋果電腦請務(wù)必提前做好雙系統(tǒng)?，F(xiàn)場不得錄音錄像。
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時(shí)間安排 |
課程表 |
介紹 |
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第 一 天 ? ? ? ? ? ? ? ? ? |
9:00~10:00 ? ? |
生信簡介 ? ? |
生物信息介紹 |
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高通量：測序及芯片介紹——不同組學(xué)：轉(zhuǎn)錄組學(xué)、基因組學(xué)、表觀組學(xué)、順反組學(xué)、宏基因組學(xué)等。 |
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經(jīng)典生信SCI文章的解讀，了解TCGA數(shù)據(jù)庫、GEO?數(shù)據(jù)庫這些公共數(shù)據(jù)的挖掘獲得創(chuàng)新結(jié)論并發(fā)文章的思路。 |
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10:15~12:00 ? ? ? ? |
TCGA數(shù)據(jù)庫 NCBI GEO數(shù)據(jù)庫 ? ? ? ? ? |
TCGA數(shù)據(jù)庫：最全的癌癥高通量數(shù)據(jù)公共庫(簡介) |
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TCGA數(shù)據(jù)庫的產(chǎn)生過程 |
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TCGA數(shù)據(jù)庫的介紹和使用（包含了轉(zhuǎn)錄組、基因組、表觀組和臨床信息數(shù)據(jù)） |
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GEO數(shù)據(jù)庫介紹：?數(shù)據(jù)量最大的高通量公共數(shù)據(jù)庫。 |
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GEO數(shù)據(jù)庫的高通量芯片數(shù)據(jù)查找、篩選、探針轉(zhuǎn)換、差異分析等。 |
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13:30~15:00 |
TCGA相關(guān)的下載工具 |
TCGA數(shù)據(jù)庫癌癥數(shù)據(jù)下載：RNA-seq數(shù)據(jù)、miRNA-seq數(shù)據(jù)、甲基化數(shù)據(jù)、基因組數(shù)據(jù)及臨床信息數(shù)據(jù)的下載 |
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15:20~17:00 |
TCGA相關(guān)的分析工具 |
TCGA數(shù)據(jù)分析——突變分析、差異分析、關(guān)聯(lián)分析、生存分析、miRNA調(diào)控靶基因分析等。 |
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第 二 天 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? |
8:30~12:00 ? ? ? ? ? |
TCGA數(shù)據(jù)的后續(xù)高級分析工具實(shí)戰(zhàn) ? ? ? ? ? |
功能富集分析——GO富集和KEGG pathway富集分析 |
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通路map圖構(gòu)建 |
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聚類熱圖制作 |
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蛋白互作分析（PPI）及網(wǎng)絡(luò)圖構(gòu)建 |
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網(wǎng)絡(luò)分析及hub蛋白/基因獲得。 |
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13:30~15:00 ? ? ? |
TCGA數(shù)據(jù)庫與GEO數(shù)據(jù)庫挖掘 ? ? ? |
基于TCGA的lncRNA-miRNA-mRNA全轉(zhuǎn)錄組整合分析思路演練 |
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基于TCGA的甲基化與轉(zhuǎn)錄組整合分析思路演練 |
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基于TCGA的基因組與轉(zhuǎn)錄組整合分析思路演練 |
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基于GEO數(shù)據(jù)庫多套數(shù)據(jù)整合（meta）分析思路演練 |
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15:20~16:30 |
整體演練 |
在電腦上快速完成從頭到尾的一套數(shù)據(jù)實(shí)戰(zhàn)，及答疑 |
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示例圖 通路富集分析結(jié)果圖
示例圖 GO富集分析結(jié)果圖
示例圖 聚類熱圖分析
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示例圖 蛋白互作網(wǎng)絡(luò)圖
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示例圖 pathway map圖
示例圖 關(guān)鍵基因的KM生存曲線圖
示例圖 venn圖
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會議嘉賓
（最終出席嘉賓以會議現(xiàn)場為準(zhǔn)）
講師簡介
宋偉博士
成果：參與完成了近百篇軟件著作權(quán)和發(fā)明專利的撰寫和申請；肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等數(shù)據(jù)庫的分析和構(gòu)建；完成個(gè)體基因檢測流程和無創(chuàng)唐篩流程的開發(fā)。
研究方向：有近十年的生信分析經(jīng)驗(yàn)，擅長方向有轉(zhuǎn)錄組測序分析、芯片數(shù)據(jù)分析、疾病機(jī)理研究分析、疾病預(yù)后與基因關(guān)聯(lián)分析、項(xiàng)目分析思路設(shè)計(jì)以及個(gè)性化分析等，精通perl、R等編程語言。
培訓(xùn)經(jīng)歷：在上海、沈陽、濟(jì)南、武漢等城市舉辦過十幾場培訓(xùn)班。培訓(xùn)的對象有：醫(yī)生、學(xué)生、科研工作者、生信愛好者等。
培訓(xùn)方向：《測序與芯片數(shù)據(jù)分析》、《生物信息學(xué)的魅力》、《生信文章實(shí)例解讀》、《生信與實(shí)驗(yàn)的密切關(guān)系》、《生信與臨床醫(yī)學(xué)的關(guān)系》、《生信實(shí)用工具培訓(xùn)》、《多組學(xué)整合分析流程》、《R語言培訓(xùn)》等
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參會指南
會議門票
學(xué)習(xí)費(fèi)2800元每位（學(xué)習(xí)費(fèi)包含電子版教材、午餐，住宿費(fèi)自理，保證學(xué)員完全掌握。）
優(yōu)惠政策：
1. 提前支付轉(zhuǎn)賬的可提前拿到學(xué)習(xí)資料
2. 三人組團(tuán)報(bào)名，每人收費(fèi)2700元
3. ?四人組團(tuán)報(bào)名，每人收費(fèi)2600元
4. ?五人組團(tuán)報(bào)名繳費(fèi)，額外帶一人免費(fèi)注冊！?
5. 參加過醫(yī)藥加測序與芯片數(shù)據(jù)挖掘的學(xué)員只要再支付1000元
可以開正規(guī)會務(wù)發(fā)票，紙質(zhì)邀請函（蓋紅章）。?
注意事項(xiàng)：攜帶windows系統(tǒng)的電腦，蘋果電腦請務(wù)必提前做好雙系統(tǒng)?，F(xiàn)場不得錄音錄像。
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溫馨提示
酒店與住宿:
為防止極端情況下活動(dòng)延期或取消，建議“異地客戶”與活動(dòng)家客服確認(rèn)參會信息后，再安排出行與住宿。
退款規(guī)則:
活動(dòng)各項(xiàng)資源需提前采購，購票后不支持退款，可以換人參加。
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部分參會單位
- 上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬上海兒童醫(yī)學(xué)中心
- 北京大學(xué)人民醫(yī)院（北京大學(xué)第二臨床醫(yī)學(xué)院）
- 煙臺毓璜頂醫(yī)院
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