TCGA&GEO生信高通量數(shù)據(jù)挖掘分析研討會2019(10月長沙班)
時間:2019-10-12 08:00 至 2019-10-13 18:00
地點:長沙

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首頁 > 商務會議 > 醫(yī)療醫(yī)學會議 > TCGA&GEO生信高通量數(shù)據(jù)挖掘分析研討會2019(10月長沙班) 更新時間:2020-01-03T14:56:03
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![]() TCGA&GEO生信高通量數(shù)據(jù)挖掘分析研討會2019(10月長沙班) 已截止報名會議時間: 2019-10-12 08:00至 2019-10-13 18:00結束 主辦單位: 上海遐永醫(yī)藥科技 醫(yī)藥加科研培訓中心 上海遐錦生物科技有限公司
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會議介紹
會議內容 主辦方介紹
TCGA&GEO生信高通量數(shù)據(jù)挖掘分析研討會2019(10月長沙班)宣傳圖
TCGA&GEO生信高通量數(shù)據(jù)挖掘分析研討會
(長沙 ·岳麓區(qū)?2019.10.12-13)
培訓簡介:
癌癥是臨床醫(yī)學中非常重要的疾病方向。TCGA數(shù)據(jù)庫中包含了常見了40種癌癥方向(含30000個樣本)的高通量數(shù)據(jù)及臨床信息。大家對TCGA數(shù)據(jù)庫的使用近幾年也在逐漸增加!如圖1所示。
圖1 :?pubmed數(shù)據(jù)庫檢索的包含“TCGA”發(fā)表的SCI 文章數(shù)量(2018.11.07)
關鍵靶標分析是指基于生信的方法從高通量數(shù)據(jù)中挖掘到與研究方向最相關的靶標基因(mRNA,miRNA,lncRNA或蛋白)。
因此,需要我們自己掌握高通量數(shù)據(jù)挖掘的能力以及邏輯性的生信分析思路,從海量信息中獲得自己想要的關鍵基因!
培訓預期:
1. 通過兩整天培訓,掌握TCGA,GEO數(shù)據(jù)庫的使用、下載及高通量數(shù)據(jù)分析思路和實用操作知識點。
2. 可以獨立完成一篇基于公共數(shù)據(jù)庫的高通量數(shù)據(jù)挖掘分析。
3. 課后贈送1小時全場串聯(lián)視頻,用于學員復習。
4. 贈送一份最近5年的高價值國自然標書(醫(yī)藥加高價值標書庫里面選擇)
5. 講師團隊贈送TCGA數(shù)據(jù)庫甲基化、基因表達譜整合分析報告和疾病mRNA+lncRNA分析報告
主辦方:醫(yī)藥加平臺
承辦方:上海遐永醫(yī)藥科技有限公司
培訓時間:2019年10月12-13日,11日可報到(下午3點-晚上9點)?12日報到時間為7點30-8點30
上課時間:上午9:00-12:00,下午1:30-6:00
培訓地點:長沙金楓大酒店??長沙市岳麓區(qū)楓林二路139號
通過本次學習,您可以學會以下作圖
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南京巴傲得生物科技有限公司(Biogottechnology,co,Ltd),是專一服務于生命科學研究的專業(yè)技術型企業(yè)。是一大批志同道合的資深專業(yè)人士共同創(chuàng)辦的具有現(xiàn)代化經營管理水平的生物高科技企業(yè),從事生物技術產品的開發(fā)及銷售,致力于將巴傲得生物打造成中國乃至世界一流的生物技術產品供應商。巴傲得生物長期備有Bioworld抗體現(xiàn)貨4000多種抗體可以在一周左右送到客戶的手里。精湛品質、合理價格、專業(yè)服務,是我們?yōu)槟盏淖谥肌T诩毎盘柾?、免疫學、蛋白組學上擁有顯著優(yōu)勢,其抗體產品、生長因子等為生命科學科研工作者提供了極大的便利。

舉辦了2018腸道菌群與代謝組學國自然課題設計及研究策略專題會議(12月北京班) 2019臨床預測模型構建與基于R語言統(tǒng)計分析學習班(01.05-01.06北京班) 2019全國循證醫(yī)學Meta分析及網狀Meta三天精講學習班(1月北京班) 第10期測序與芯片高通量數(shù)據(jù)挖掘與分析學習班2019(1月上海班) 2019腸道菌群與代謝組學國自然課題設計及研究策略專題會議(1月上海班) 2019國自然基金標書構思與撰寫學習班(1月上海班) TCGA,GEO生信高通量數(shù)據(jù)挖掘專題學習班2019(1月上海班) 第8期醫(yī)學SCI論文寫作及發(fā)表技巧學習班2019(1月上海班) ......

上海遐錦生物科技有限公司于2019年11月29日舉辦全國循證醫(yī)學Meta分析與網狀Meta研討會2019(11月上海班)會議。
會議日程
(最終日程以會議現(xiàn)場為準)
詳細課程安排見課表
TCGA&GEO高通量數(shù)據(jù)挖掘分析班課表 | |||
日期 | 時間 | 課程安排 | 內容介紹 |
周六上午 | 9:00-10:00 | 生信簡介 | 生物信息介紹 |
高通量:測序及芯片介紹——多組學:轉錄組學、基因組學、表觀組學、宏基因組學等 | |||
經典生信SCI文章的思路解讀,了解TCGA數(shù)據(jù)庫、GEO數(shù)據(jù)庫及高通量測序數(shù)據(jù)的挖掘獲得創(chuàng)新結論并發(fā)文章的思路 | |||
10:00-10:15 | 茶歇 | ||
10:15-12:00 | TCGA數(shù)據(jù)庫 NCBI GEO數(shù)據(jù)庫 | TCGA數(shù)據(jù)庫:最全的癌癥高通量數(shù)據(jù)公共庫(簡介) | |
TCGA數(shù)據(jù)庫的產生過程 | |||
TCGA官方數(shù)據(jù)庫的介紹和使用(包含了轉錄組、基因組、表觀組和臨床信息數(shù)據(jù)) | |||
GEO數(shù)據(jù)庫介紹及使用:高通量芯片數(shù)據(jù)查找、篩選、探針轉換、差異分析等。 | |||
12:00-13:30 | 午餐及午休 | ||
周六下午 | 13:30-15:00 | TCGA相關下載工具 | TCGA數(shù)據(jù)庫據(jù)下載:RNA-seq數(shù)據(jù)、miRNA-seq數(shù)據(jù)、甲基化數(shù)據(jù)、基因組數(shù)據(jù)及臨床信息數(shù)據(jù)的下載 |
15:00-15:20 | 茶歇 | ||
15:20-17:00 | TCGA相關分析工具 | TCGA數(shù)據(jù)分析——突變分析、差異分析、關聯(lián)分析、生存分析、miRNA調控靶基因分析等。 | |
獲得生存曲線圖(KM曲線,分為臨床因素和基因表達兩種KM曲線) | |||
周日上午 | 8:30-10:30 | TCGA數(shù)據(jù)后續(xù)高級分析工具實戰(zhàn) | 功能富集分析——GO富集和KEGG pathway富集分析 |
聚類熱圖制作 | |||
10:30-10:45 | 茶歇 | ||
10:45-12:00 | TCGA數(shù)據(jù)后續(xù)高級分析工具實戰(zhàn) | 蛋白互作分析(PPI)及網絡圖構建 | |
網絡分析及hub蛋白/基因獲得。 | |||
12:00-13:30 | 午餐及午休 | ||
周日下午 | 13:30-15:00 | TCGA數(shù)據(jù)庫與GEO數(shù)據(jù)庫挖掘 | 基于TCGA的lncRNA-miRNA-mRNA全轉錄組整合分析思路演練 基于TCGA的甲基化與轉錄組整合分析思路演練 基于GEO數(shù)據(jù)庫多套數(shù)據(jù)整合(meta)分析思路演練 |
15:00-15:20 | |||
15:20-16:30 | 整體演練并錄屏 | 在電腦上快速完成從頭到尾的一套數(shù)據(jù)實戰(zhàn),及答疑 | |
注意事項:學員需自己帶電腦,要求為windows系統(tǒng),現(xiàn)場不得錄音錄像,上課所用軟件為Heml和GSEA |
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會議嘉賓
(最終出席嘉賓以會議現(xiàn)場為準)
講師簡介:宋偉博士
成果:參與完成了近百篇軟件著作權和發(fā)明專利的撰寫和申請;肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等數(shù)據(jù)庫的分析和構建;完成個體基因檢測流程和無創(chuàng)唐篩流程的開發(fā)。
研究方向:有近十年的生信分析經驗,擅長方向有轉錄組測序分析、芯片數(shù)據(jù)分析、疾病機理研究分析、疾病預后與基因關聯(lián)分析、項目分析思路設計以及個性化分析等,精通perl、R等編程語言。
培訓經歷:在上海、北京、廣州、沈陽、南京等城市舉辦過幾十場培訓班。
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參會指南
會議門票
收費標準:會務費:2800元每位(會務費包含電子版教材、午餐,住宿費自理。)
優(yōu)惠政策:
1.提前確認報名及轉賬的,可以提前拿到學習材料
2.三人組團報名,每人優(yōu)惠100元
3.四人組團報名,每人優(yōu)惠200元,
4.五人組團報名繳費,額外帶一人免費注冊!?
可以開正規(guī)會務發(fā)票,紙質邀請函(蓋紅章)。?
推薦住宿長沙金楓大酒店,289元/間 住宿自理
注意事項:必須攜帶win7以上系統(tǒng)的電腦,現(xiàn)場不得錄音錄像。提前安裝好Heml和GSEA軟件(可提前向主辦方索要安裝包)
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溫馨提示
酒店與住宿:
為防止極端情況下活動延期或取消,建議“異地客戶”與活動家客服確認參會信息后,再安排出行與住宿。
退款規(guī)則:
活動各項資源需提前采購,購票后不支持退款,可以換人參加。
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