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        首頁 > 商務會議 > 醫(yī)療醫(yī)學會議 > TCGA&GEO生信高通量數(shù)據(jù)挖掘分析學習班2019(7月成都班) 更新時間:2019-06-03T16:59:52

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        TCGA&GEO生信高通量數(shù)據(jù)挖掘分析學習班2019(7月成都班)
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        官方合作

        TCGA&GEO生信高通量數(shù)據(jù)挖掘分析學習班2019(7月成都班) 已截止報名

        會議時間: 2019-07-13 09:00至 2019-07-14 16:30結(jié)束

        會議地點: 成都  成都金玉陽光酒店  成都成華區(qū)雙林路88號 周邊酒店預訂

        主辦單位: 上海遐永醫(yī)藥科技 醫(yī)藥加科研培訓中心 上海遐錦生物科技有限公司

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              會議介紹

              會議內(nèi)容 主辦方介紹


              TCGA&GEO生信高通量數(shù)據(jù)挖掘分析學習班2019(7月成都班)

              TCGA&GEO生信高通量數(shù)據(jù)挖掘分析學習班2019(7月成都班)宣傳圖

              培訓簡介:

              癌癥是臨床醫(yī)學中非常重要的疾病方向。TCGA數(shù)據(jù)庫中包含了常見了40種癌癥方向(含30000個樣本)的高通量數(shù)據(jù)及臨床信息。大家對TCGA數(shù)據(jù)庫的使用近幾年也在逐漸增加!如圖1所示。

              TCGA&GEO生信高通量數(shù)據(jù)挖掘分析學習班2019(7月成都班)

              圖1 : pubmed數(shù)據(jù)庫檢索的包含“TCGA”發(fā)表的SCI 文章數(shù)量(2018.11.07)

              關鍵靶標分析是指基于生信的方法從高通量數(shù)據(jù)中挖掘到與研究方向最相關的靶標基因(mRNA,miRNA,lncRNA或蛋白)。

              因此,需要我們自己掌握高通量數(shù)據(jù)挖掘的能力以及邏輯性的生信分析思路,從海量信息中獲得自己想要的關鍵基因!


              培訓預期:

              1. 通過兩整天培訓,掌握TCGA,GEO數(shù)據(jù)庫的使用、下載及高通量數(shù)據(jù)分析思路和實用操作知識點。

              2. 可以獨立完成一篇基于公共數(shù)據(jù)庫的高通量數(shù)據(jù)挖掘分析。

              3. 課后贈送1小時全場串聯(lián)視頻,用于學員復習。

              4. 贈送一份最近5年的高價值國自然標書(醫(yī)藥加高價值標書庫里面選擇)

              5. 講師團隊贈送TCGA數(shù)據(jù)庫甲基化、基因表達譜整合分析報告和疾病mRNA+lncRNA分析報告


              主辦方:醫(yī)藥加平臺

              承辦方:上海遐永醫(yī)藥科技有限公司

              培訓時間:2019年7月13-14日,12日可報到(下午3點-晚上9點)

              上課時間:上午9:00-12:00,下午1:30-6:00

              培訓地點:成都成華區(qū)雙林路88號 成都金玉陽光酒店

              查看更多

              上海遐永醫(yī)藥科技

              南京巴傲得生物科技有限公司(Biogottechnology,co,Ltd),是專一服務于生命科學研究的專業(yè)技術型企業(yè)。是一大批志同道合的資深專業(yè)人士共同創(chuàng)辦的具有現(xiàn)代化經(jīng)營管理水平的生物高科技企業(yè),從事生物技術產(chǎn)品的開發(fā)及銷售,致力于將巴傲得生物打造成中國乃至世界一流的生物技術產(chǎn)品供應商。巴傲得生物長期備有Bioworld抗體現(xiàn)貨4000多種抗體可以在一周左右送到客戶的手里。精湛品質(zhì)、合理價格、專業(yè)服務,是我們?yōu)槟盏淖谥?。在細胞信號通路、免疫學、蛋白組學上擁有顯著優(yōu)勢,其抗體產(chǎn)品、生長因子等為生命科學科研工作者提供了極大的便利。

              醫(yī)藥加科研培訓中心 醫(yī)藥加科研培訓中心

              舉辦了2018腸道菌群與代謝組學國自然課題設計及研究策略專題會議(12月北京班) 2019臨床預測模型構建與基于R語言統(tǒng)計分析學習班(01.05-01.06北京班) 2019全國循證醫(yī)學Meta分析及網(wǎng)狀Meta三天精講學習班(1月北京班) 第10期測序與芯片高通量數(shù)據(jù)挖掘與分析學習班2019(1月上海班) 2019腸道菌群與代謝組學國自然課題設計及研究策略專題會議(1月上海班) 2019國自然基金標書構思與撰寫學習班(1月上海班) TCGA,GEO生信高通量數(shù)據(jù)挖掘?qū)n}學習班2019(1月上海班) 第8期醫(yī)學SCI論文寫作及發(fā)表技巧學習班2019(1月上海班) ......

              上海遐錦生物科技有限公司 上海遐錦生物科技有限公司

              上海遐錦生物科技有限公司于2019年11月29日舉辦全國循證醫(yī)學Meta分析與網(wǎng)狀Meta研討會2019(11月上海班)會議。

              會議日程 (最終日程以會議現(xiàn)場為準)


              TCGA&GEO高通量數(shù)據(jù)挖掘分析班課表

              日期

              時間

              課程安排

              內(nèi)容介紹

              周六上午

              9:00-10:00

              生信簡介

              生物信息介紹

              高通量:測序及芯片介紹——多組學:轉(zhuǎn)錄組學、基因組學、表觀組學、宏基因組學等

              經(jīng)典生信SCI文章的思路解讀,了解TCGA數(shù)據(jù)庫、GEO數(shù)據(jù)庫及高通量測序數(shù)據(jù)的挖掘獲得創(chuàng)新結(jié)論并發(fā)文章的思路

              10:00-10:15

              茶歇

              10:15-12:00

              TCGA數(shù)據(jù)庫

              NCBI GEO數(shù)據(jù)庫

              TCGA數(shù)據(jù)庫:最全的癌癥高通量數(shù)據(jù)公共庫(簡介)

              TCGA數(shù)據(jù)庫的產(chǎn)生過程

              TCGA官方數(shù)據(jù)庫的介紹和使用(包含了轉(zhuǎn)錄組、基因組、表觀組和臨床信息數(shù)據(jù))

              GEO數(shù)據(jù)庫介紹及使用:高通量芯片數(shù)據(jù)查找、篩選、探針轉(zhuǎn)換、差異分析等。


              12:00-13:30

              午餐及午休

              周六下午

              13:30-15:00

              TCGA相關下載工具

              TCGA數(shù)據(jù)庫據(jù)下載:RNA-seq數(shù)據(jù)、miRNA-seq數(shù)據(jù)、甲基化數(shù)據(jù)、基因組數(shù)據(jù)及臨床信息數(shù)據(jù)的下載
              TCGA數(shù)據(jù)書庫癌癥數(shù)據(jù)的處理,獲得關鍵mRNA、miRNA的表達譜矩陣。

              15:00-15:20

              茶歇

              15:20-17:00

              TCGA相關分析工具

              TCGA數(shù)據(jù)分析——突變分析、差異分析、關聯(lián)分析、生存分析、miRNA調(diào)控靶基因分析等。

              獲得生存曲線圖(KM曲線,分為臨床因素和基因表達兩種KM曲線)


              周日上午

              8:30-10:30

              TCGA數(shù)據(jù)后續(xù)高級分析工具實戰(zhàn)

              功能富集分析——GO富集和KEGG pathway富集分析

              聚類熱圖制作

              10:30-10:45

              茶歇

              10:45-12:00

              TCGA數(shù)據(jù)后續(xù)高級分析工具實戰(zhàn)

              蛋白互作分析(PPI)及網(wǎng)絡圖構建

              網(wǎng)絡分析及hub蛋白/基因獲得。


              12:00-13:30

              午餐及午休

              周日下午

              13:30-15:00

              TCGA數(shù)據(jù)庫與GEO數(shù)據(jù)庫挖掘

              基于TCGA的lncRNA-miRNA-mRNA全轉(zhuǎn)錄組整合分析思路演練

              基于TCGA的甲基化與轉(zhuǎn)錄組整合分析思路演練

              基于GEO數(shù)據(jù)庫多套數(shù)據(jù)整合(meta)分析思路演練

              15:00-15:20



              15:20-16:30

              整體演練并錄屏

              在電腦上快速完成從頭到尾的一套數(shù)據(jù)實戰(zhàn),及答疑

              注意事項:學員需自己帶電腦,要求為windows系統(tǒng),現(xiàn)場不得錄音錄像,上課所用軟件為Heml


              通過本次學習,您可以學會以下作圖


              TCGA&GEO生信高通量數(shù)據(jù)挖掘分析學習班2019(7月成都班)

              示例圖 通路富集分析結(jié)果圖

              TCGA&GEO生信高通量數(shù)據(jù)挖掘分析學習班2019(7月成都班)

              示例圖 基因突變元件圖

              TCGA&GEO生信高通量數(shù)據(jù)挖掘分析學習班2019(7月成都班)

              示例圖 聚類熱圖分析

              TCGA&GEO生信高通量數(shù)據(jù)挖掘分析學習班2019(7月成都班)

              示例圖 GEO富集分析結(jié)果圖

              TCGA&GEO生信高通量數(shù)據(jù)挖掘分析學習班2019(7月成都班)

              示例圖 蛋白互作網(wǎng)絡圖

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              會議嘉賓 (最終出席嘉賓以會議現(xiàn)場為準)


              講師簡介:宋偉博士

              成果:參與完成了近百篇軟件著作權和發(fā)明專利的撰寫和申請;肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等數(shù)據(jù)庫的分析和構建;完成個體基因檢測流程和無創(chuàng)唐篩流程的開發(fā)。

              研究方向:有近十年的生信分析經(jīng)驗,擅長方向有轉(zhuǎn)錄組測序分析、芯片數(shù)據(jù)分析、疾病機理研究分析、疾病預后與基因關聯(lián)分析、項目分析思路設計以及個性化分析等,精通perl、R等編程語言。

              培訓經(jīng)歷:在上海、北京、廣州、沈陽、南京等城市舉辦過幾十場培訓班。

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              參會指南

              會議門票 場館介紹


              收費標準:2800元/人(會務費包含電子版教材、午餐,住宿費自理。)

              優(yōu)惠政策:

              1.提前確認報名及轉(zhuǎn)賬的,可以提前拿到學習材料

              2.三人組團報名,每人優(yōu)惠100元

              3.四人組團報名,每人優(yōu)惠200元,

              4.五人組團報名繳費,額外帶一人免費注冊!

              可以開正規(guī)會務發(fā)票,紙質(zhì)邀請函(蓋紅章)。

              推薦住宿:

              ???????成都金玉陽光酒店,350元/間,住宿自理

              注意事項:學員需自己帶電腦,要求為windows系統(tǒng),現(xiàn)場不得錄音錄像,上課所用軟件為Heml

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              成都金玉陽光酒店 成都金玉陽光酒店

              金玉陽光酒店是中石油玉門油田旗下的金葉級綠色四星級酒店。擁有154套客房,是綜合了中餐廳、西餐廳、大堂水吧、休閑茶坊為一體的商務休閑型酒店。同時,酒店內(nèi)設一個大型多功能會議廳及三個中小型會議室,并配備了其他相關先進的服務設施。長興食府是位于酒店附樓的中餐廳,以經(jīng)營精品特色川菜、粵菜

              溫馨提示
              酒店與住宿: 為防止極端情況下活動延期或取消,建議“異地客戶”與活動家客服確認參會信息后,再安排出行與住宿。
              退款規(guī)則: 活動各項資源需提前采購,購票后不支持退款,可以換人參加。

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