TCGA&GEO生信高通量數(shù)據(jù)挖掘分析學習班2019(7月成都班)
時間:2019-07-13 09:00 至 2019-07-14 16:30
地點:成都

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首頁 > 商務會議 > 醫(yī)療醫(yī)學會議 > TCGA&GEO生信高通量數(shù)據(jù)挖掘分析學習班2019(7月成都班) 更新時間:2019-06-03T16:59:52
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![]() TCGA&GEO生信高通量數(shù)據(jù)挖掘分析學習班2019(7月成都班) 已截止報名會議時間: 2019-07-13 09:00至 2019-07-14 16:30結(jié)束 會議地點: 成都 成都金玉陽光酒店 成都成華區(qū)雙林路88號 周邊酒店預訂 主辦單位: 上海遐永醫(yī)藥科技 醫(yī)藥加科研培訓中心 上海遐錦生物科技有限公司
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會議介紹
會議內(nèi)容 主辦方介紹

TCGA&GEO生信高通量數(shù)據(jù)挖掘分析學習班2019(7月成都班)宣傳圖
培訓簡介:
癌癥是臨床醫(yī)學中非常重要的疾病方向。TCGA數(shù)據(jù)庫中包含了常見了40種癌癥方向(含30000個樣本)的高通量數(shù)據(jù)及臨床信息。大家對TCGA數(shù)據(jù)庫的使用近幾年也在逐漸增加!如圖1所示。
圖1 : pubmed數(shù)據(jù)庫檢索的包含“TCGA”發(fā)表的SCI 文章數(shù)量(2018.11.07)
關鍵靶標分析是指基于生信的方法從高通量數(shù)據(jù)中挖掘到與研究方向最相關的靶標基因(mRNA,miRNA,lncRNA或蛋白)。
因此,需要我們自己掌握高通量數(shù)據(jù)挖掘的能力以及邏輯性的生信分析思路,從海量信息中獲得自己想要的關鍵基因!
培訓預期:
1. 通過兩整天培訓,掌握TCGA,GEO數(shù)據(jù)庫的使用、下載及高通量數(shù)據(jù)分析思路和實用操作知識點。
2. 可以獨立完成一篇基于公共數(shù)據(jù)庫的高通量數(shù)據(jù)挖掘分析。
3. 課后贈送1小時全場串聯(lián)視頻,用于學員復習。
4. 贈送一份最近5年的高價值國自然標書(醫(yī)藥加高價值標書庫里面選擇)
5. 講師團隊贈送TCGA數(shù)據(jù)庫甲基化、基因表達譜整合分析報告和疾病mRNA+lncRNA分析報告
主辦方:醫(yī)藥加平臺
承辦方:上海遐永醫(yī)藥科技有限公司
培訓時間:2019年7月13-14日,12日可報到(下午3點-晚上9點)
上課時間:上午9:00-12:00,下午1:30-6:00
培訓地點:成都成華區(qū)雙林路88號 成都金玉陽光酒店
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南京巴傲得生物科技有限公司(Biogottechnology,co,Ltd),是專一服務于生命科學研究的專業(yè)技術型企業(yè)。是一大批志同道合的資深專業(yè)人士共同創(chuàng)辦的具有現(xiàn)代化經(jīng)營管理水平的生物高科技企業(yè),從事生物技術產(chǎn)品的開發(fā)及銷售,致力于將巴傲得生物打造成中國乃至世界一流的生物技術產(chǎn)品供應商。巴傲得生物長期備有Bioworld抗體現(xiàn)貨4000多種抗體可以在一周左右送到客戶的手里。精湛品質(zhì)、合理價格、專業(yè)服務,是我們?yōu)槟盏淖谥?。在細胞信號通路、免疫學、蛋白組學上擁有顯著優(yōu)勢,其抗體產(chǎn)品、生長因子等為生命科學科研工作者提供了極大的便利。

舉辦了2018腸道菌群與代謝組學國自然課題設計及研究策略專題會議(12月北京班) 2019臨床預測模型構建與基于R語言統(tǒng)計分析學習班(01.05-01.06北京班) 2019全國循證醫(yī)學Meta分析及網(wǎng)狀Meta三天精講學習班(1月北京班) 第10期測序與芯片高通量數(shù)據(jù)挖掘與分析學習班2019(1月上海班) 2019腸道菌群與代謝組學國自然課題設計及研究策略專題會議(1月上海班) 2019國自然基金標書構思與撰寫學習班(1月上海班) TCGA,GEO生信高通量數(shù)據(jù)挖掘?qū)n}學習班2019(1月上海班) 第8期醫(yī)學SCI論文寫作及發(fā)表技巧學習班2019(1月上海班) ......

上海遐錦生物科技有限公司于2019年11月29日舉辦全國循證醫(yī)學Meta分析與網(wǎng)狀Meta研討會2019(11月上海班)會議。
會議日程
(最終日程以會議現(xiàn)場為準)
日期 | 時間 | 課程安排 | 內(nèi)容介紹 |
周六上午 | 9:00-10:00 | 生信簡介 | 生物信息介紹 |
高通量:測序及芯片介紹——多組學:轉(zhuǎn)錄組學、基因組學、表觀組學、宏基因組學等 | |||
經(jīng)典生信SCI文章的思路解讀,了解TCGA數(shù)據(jù)庫、GEO數(shù)據(jù)庫及高通量測序數(shù)據(jù)的挖掘獲得創(chuàng)新結(jié)論并發(fā)文章的思路 | |||
10:00-10:15 | 茶歇 | ||
10:15-12:00 | TCGA數(shù)據(jù)庫 NCBI GEO數(shù)據(jù)庫 | TCGA數(shù)據(jù)庫:最全的癌癥高通量數(shù)據(jù)公共庫(簡介) | |
TCGA數(shù)據(jù)庫的產(chǎn)生過程 | |||
TCGA官方數(shù)據(jù)庫的介紹和使用(包含了轉(zhuǎn)錄組、基因組、表觀組和臨床信息數(shù)據(jù)) | |||
GEO數(shù)據(jù)庫介紹及使用:高通量芯片數(shù)據(jù)查找、篩選、探針轉(zhuǎn)換、差異分析等。 | |||
12:00-13:30 | 午餐及午休 | ||
周六下午 | 13:30-15:00 | TCGA相關下載工具 | TCGA數(shù)據(jù)庫據(jù)下載:RNA-seq數(shù)據(jù)、miRNA-seq數(shù)據(jù)、甲基化數(shù)據(jù)、基因組數(shù)據(jù)及臨床信息數(shù)據(jù)的下載 |
15:00-15:20 | 茶歇 | ||
15:20-17:00 | TCGA相關分析工具 | TCGA數(shù)據(jù)分析——突變分析、差異分析、關聯(lián)分析、生存分析、miRNA調(diào)控靶基因分析等。 | |
獲得生存曲線圖(KM曲線,分為臨床因素和基因表達兩種KM曲線) | |||
周日上午 | 8:30-10:30 | TCGA數(shù)據(jù)后續(xù)高級分析工具實戰(zhàn) | 功能富集分析——GO富集和KEGG pathway富集分析 |
聚類熱圖制作 | |||
10:30-10:45 | 茶歇 | ||
10:45-12:00 | TCGA數(shù)據(jù)后續(xù)高級分析工具實戰(zhàn) | 蛋白互作分析(PPI)及網(wǎng)絡圖構建 | |
網(wǎng)絡分析及hub蛋白/基因獲得。 | |||
12:00-13:30 | 午餐及午休 | ||
周日下午 | 13:30-15:00 | TCGA數(shù)據(jù)庫與GEO數(shù)據(jù)庫挖掘 | 基于TCGA的lncRNA-miRNA-mRNA全轉(zhuǎn)錄組整合分析思路演練 基于TCGA的甲基化與轉(zhuǎn)錄組整合分析思路演練 基于GEO數(shù)據(jù)庫多套數(shù)據(jù)整合(meta)分析思路演練 |
15:00-15:20 | |||
15:20-16:30 | 整體演練并錄屏 | 在電腦上快速完成從頭到尾的一套數(shù)據(jù)實戰(zhàn),及答疑 | |
注意事項:學員需自己帶電腦,要求為windows系統(tǒng),現(xiàn)場不得錄音錄像,上課所用軟件為Heml |
通過本次學習,您可以學會以下作圖
示例圖 通路富集分析結(jié)果圖
示例圖 基因突變元件圖
示例圖 聚類熱圖分析
示例圖 GEO富集分析結(jié)果圖
示例圖 蛋白互作網(wǎng)絡圖
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會議嘉賓
(最終出席嘉賓以會議現(xiàn)場為準)
講師簡介:宋偉博士
成果:參與完成了近百篇軟件著作權和發(fā)明專利的撰寫和申請;肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等數(shù)據(jù)庫的分析和構建;完成個體基因檢測流程和無創(chuàng)唐篩流程的開發(fā)。
研究方向:有近十年的生信分析經(jīng)驗,擅長方向有轉(zhuǎn)錄組測序分析、芯片數(shù)據(jù)分析、疾病機理研究分析、疾病預后與基因關聯(lián)分析、項目分析思路設計以及個性化分析等,精通perl、R等編程語言。
培訓經(jīng)歷:在上海、北京、廣州、沈陽、南京等城市舉辦過幾十場培訓班。
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參會指南
會議門票 場館介紹
收費標準:2800元/人(會務費包含電子版教材、午餐,住宿費自理。)
優(yōu)惠政策:
1.提前確認報名及轉(zhuǎn)賬的,可以提前拿到學習材料
2.三人組團報名,每人優(yōu)惠100元
3.四人組團報名,每人優(yōu)惠200元,
4.五人組團報名繳費,額外帶一人免費注冊!
可以開正規(guī)會務發(fā)票,紙質(zhì)邀請函(蓋紅章)。
推薦住宿:
???????成都金玉陽光酒店,350元/間,住宿自理
注意事項:學員需自己帶電腦,要求為windows系統(tǒng),現(xiàn)場不得錄音錄像,上課所用軟件為Heml
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金玉陽光酒店是中石油玉門油田旗下的金葉級綠色四星級酒店。擁有154套客房,是綜合了中餐廳、西餐廳、大堂水吧、休閑茶坊為一體的商務休閑型酒店。同時,酒店內(nèi)設一個大型多功能會議廳及三個中小型會議室,并配備了其他相關先進的服務設施。長興食府是位于酒店附樓的中餐廳,以經(jīng)營精品特色川菜、粵菜
溫馨提示
酒店與住宿:
為防止極端情況下活動延期或取消,建議“異地客戶”與活動家客服確認參會信息后,再安排出行與住宿。
退款規(guī)則:
活動各項資源需提前采購,購票后不支持退款,可以換人參加。
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