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        首頁(yè) > 商務(wù)會(huì)議 > 醫(yī)療醫(yī)學(xué)會(huì)議 > TCGA,GEO生信高通量數(shù)據(jù)挖掘?qū)n}學(xué)習(xí)班2019(1月上海班) 更新時(shí)間:2018-12-18T14:11:20

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        TCGA,GEO生信高通量數(shù)據(jù)挖掘?qū)n}學(xué)習(xí)班2019(1月上海班)
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        TCGA,GEO生信高通量數(shù)據(jù)挖掘?qū)n}學(xué)習(xí)班2019(1月上海班) 已截止報(bào)名

        會(huì)議時(shí)間: 2019-01-19 08:00至 2019-01-20 18:00結(jié)束

        會(huì)議地點(diǎn): 上海  上海浦東中興和泰酒店  浦東新區(qū)科苑路866號(hào) 周邊酒店預(yù)訂

        主辦單位: 上海遐永醫(yī)藥科技 醫(yī)藥加科研培訓(xùn)中心

        行業(yè)熱銷(xiāo)熱門(mén)關(guān)注看了又看 換一換

              會(huì)議介紹

              會(huì)議內(nèi)容 主辦方介紹


              TCGA,GEO生信高通量數(shù)據(jù)挖掘?qū)n}學(xué)習(xí)班2019(1月上海班)

              TCGA,GEO生信高通量數(shù)據(jù)挖掘?qū)n}學(xué)習(xí)班2019(1月上海班)宣傳圖

              TCGA,GEO生信高通量數(shù)據(jù)挖掘?qū)n}學(xué)習(xí)班

              2019/1/19-20(18號(hào)報(bào)到)

              上海浦東中興和泰酒店

              注意事項(xiàng):攜帶windows系統(tǒng)的電腦,蘋(píng)果電腦請(qǐng)務(wù)必提前做好雙系統(tǒng)?,F(xiàn)場(chǎng)不得錄音錄像。


              培訓(xùn)目的與培訓(xùn)預(yù)期

              培訓(xùn)簡(jiǎn)介:

              ????癌癥是臨床醫(yī)學(xué)中非常重要的疾病方向。TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)中包含了常見(jiàn)了40種癌癥方向(含30000個(gè)樣本)的高通量數(shù)據(jù)及臨床信息。大家對(duì)TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)的使用近幾年也在逐漸增加!如圖1所示。

              TCGA,GEO生信高通量數(shù)據(jù)挖掘?qū)n}學(xué)習(xí)班2019(1月上海班)

              圖1 基于 pubmed數(shù)據(jù)庫(kù)檢索的包含“TCGA”發(fā)表的SCI 文章數(shù)量(2018年11月7日)

              關(guān)鍵靶標(biāo)分析是指基于生信的方法從高通量數(shù)據(jù)中挖掘到與研究方向最相關(guān)的靶標(biāo)基因(mRNA,miRNA,lncRNA或蛋白)。

              因此,需要我們自己掌握高通量數(shù)據(jù)挖掘的能力以及邏輯性的生信分析思路,從海量信息中獲得自己想要的關(guān)鍵基因!


              培訓(xùn)預(yù)期:

              1. 通過(guò)整整兩天的培訓(xùn),掌握TCGA,GEO數(shù)據(jù)庫(kù)的使用、下載及分析思路和實(shí)用操作知識(shí)點(diǎn)。

              2. 可以獨(dú)立完成一篇基于公共數(shù)據(jù)庫(kù)的高通量數(shù)據(jù)挖掘分析。

              3. 課后還可以贈(zèng)送1小時(shí)的全場(chǎng)串聯(lián)視頻,用于學(xué)員的復(fù)習(xí)。

              4. 贈(zèng)送一份最近5年的高價(jià)值國(guó)自然標(biāo)書(shū)(醫(yī)藥加高價(jià)值標(biāo)書(shū)庫(kù)里面選擇)

              5. 講師團(tuán)隊(duì)贈(zèng)送TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)甲基化,基因表達(dá)譜整合分析報(bào)告與疾病mRNA+lncRNA分析報(bào)告


              學(xué)習(xí)班組織方

              主辦方:醫(yī)藥加平臺(tái)

              承辦方:上海遐永醫(yī)藥科技有限公司

              查看更多

              上海遐永醫(yī)藥科技

              南京巴傲得生物科技有限公司(Biogottechnology,co,Ltd),是專(zhuān)一服務(wù)于生命科學(xué)研究的專(zhuān)業(yè)技術(shù)型企業(yè)。是一大批志同道合的資深專(zhuān)業(yè)人士共同創(chuàng)辦的具有現(xiàn)代化經(jīng)營(yíng)管理水平的生物高科技企業(yè),從事生物技術(shù)產(chǎn)品的開(kāi)發(fā)及銷(xiāo)售,致力于將巴傲得生物打造成中國(guó)乃至世界一流的生物技術(shù)產(chǎn)品供應(yīng)商。巴傲得生物長(zhǎng)期備有Bioworld抗體現(xiàn)貨4000多種抗體可以在一周左右送到客戶(hù)的手里。精湛品質(zhì)、合理價(jià)格、專(zhuān)業(yè)服務(wù),是我們?yōu)槟?wù)的宗旨。在細(xì)胞信號(hào)通路、免疫學(xué)、蛋白組學(xué)上擁有顯著優(yōu)勢(shì),其抗體產(chǎn)品、生長(zhǎng)因子等為生命科學(xué)科研工作者提供了極大的便利。

              醫(yī)藥加科研培訓(xùn)中心 醫(yī)藥加科研培訓(xùn)中心

              舉辦了2018腸道菌群與代謝組學(xué)國(guó)自然課題設(shè)計(jì)及研究策略專(zhuān)題會(huì)議(12月北京班) 2019臨床預(yù)測(cè)模型構(gòu)建與基于R語(yǔ)言統(tǒng)計(jì)分析學(xué)習(xí)班(01.05-01.06北京班) 2019全國(guó)循證醫(yī)學(xué)Meta分析及網(wǎng)狀Meta三天精講學(xué)習(xí)班(1月北京班) 第10期測(cè)序與芯片高通量數(shù)據(jù)挖掘與分析學(xué)習(xí)班2019(1月上海班) 2019腸道菌群與代謝組學(xué)國(guó)自然課題設(shè)計(jì)及研究策略專(zhuān)題會(huì)議(1月上海班) 2019國(guó)自然基金標(biāo)書(shū)構(gòu)思與撰寫(xiě)學(xué)習(xí)班(1月上海班) TCGA,GEO生信高通量數(shù)據(jù)挖掘?qū)n}學(xué)習(xí)班2019(1月上海班) 第8期醫(yī)學(xué)SCI論文寫(xiě)作及發(fā)表技巧學(xué)習(xí)班2019(1月上海班) ......

              會(huì)議日程 (最終日程以會(huì)議現(xiàn)場(chǎng)為準(zhǔn))


              注意事項(xiàng):攜帶windows系統(tǒng)的電腦,蘋(píng)果電腦請(qǐng)務(wù)必提前做好雙系統(tǒng)?,F(xiàn)場(chǎng)不得錄音錄像。

              時(shí)間安排

              課程表

              介紹

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              9:00~10:00

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              生信簡(jiǎn)介

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              生物信息介紹

              高通量:測(cè)序及芯片介紹——不同組學(xué):轉(zhuǎn)錄組學(xué)、基因組學(xué)、表觀(guān)組學(xué)、順?lè)唇M學(xué)、宏基因組學(xué)等。

              經(jīng)典生信SCI文章的解讀,了解TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)、GEO?數(shù)據(jù)庫(kù)這些公共數(shù)據(jù)的挖掘獲得創(chuàng)新結(jié)論并發(fā)文章的思路。

              10:15~12:00

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              TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)

              NCBI GEO數(shù)據(jù)庫(kù)

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              TCGA數(shù)據(jù)庫(kù):最全的癌癥高通量數(shù)據(jù)公共庫(kù)(簡(jiǎn)介)

              TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)的產(chǎn)生過(guò)程

              TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)的介紹和使用(包含了轉(zhuǎn)錄組、基因組、表觀(guān)組和臨床信息數(shù)據(jù))

              GEO數(shù)據(jù)庫(kù)介紹:?數(shù)據(jù)量最大的高通量公共數(shù)據(jù)庫(kù)。

              GEO數(shù)據(jù)庫(kù)的高通量芯片數(shù)據(jù)查找、篩選、探針轉(zhuǎn)換、差異分析等。

              13:30~15:00

              TCGA相關(guān)的下載工具

              TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)癌癥數(shù)據(jù)下載:RNA-seq數(shù)據(jù)、miRNA-seq數(shù)據(jù)、甲基化數(shù)據(jù)、基因組數(shù)據(jù)及臨床信息數(shù)據(jù)的下載
              TCGA數(shù)據(jù)書(shū)庫(kù)癌癥數(shù)據(jù)的處理,獲得關(guān)鍵mRNA、miRNA的表達(dá)譜矩陣。

              15:20~17:00

              TCGA相關(guān)的分析工具

              TCGA數(shù)據(jù)分析——突變分析、差異分析、關(guān)聯(lián)分析、生存分析、miRNA調(diào)控靶基因分析等。
              獲得生存曲線(xiàn)圖(KM曲線(xiàn),分為臨床因素和基因表達(dá)兩種KM曲線(xiàn))
              miRNA靶基因結(jié)合位點(diǎn)。

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              8:30~12:00

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              TCGA數(shù)據(jù)的后續(xù)高級(jí)分析工具實(shí)戰(zhàn)

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              功能富集分析——GO富集和KEGG pathway富集分析

              通路map圖構(gòu)建

              聚類(lèi)熱圖制作

              蛋白互作分析(PPI)及網(wǎng)絡(luò)圖構(gòu)建

              網(wǎng)絡(luò)分析及hub蛋白/基因獲得。

               

              13:30~15:00

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              TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)與GEO數(shù)據(jù)庫(kù)挖掘

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              基于TCGA的lncRNA-miRNA-mRNA全轉(zhuǎn)錄組整合分析思路演練

              基于TCGA的甲基化與轉(zhuǎn)錄組整合分析思路演練

              基于TCGA的基因組與轉(zhuǎn)錄組整合分析思路演練

              基于GEO數(shù)據(jù)庫(kù)多套數(shù)據(jù)整合(meta)分析思路演練

              15:20~16:30

              整體演練

              在電腦上快速完成從頭到尾的一套數(shù)據(jù)實(shí)戰(zhàn),及答疑

              TCGA,GEO生信高通量數(shù)據(jù)挖掘?qū)n}學(xué)習(xí)班2019(1月上海班)

              示例圖 通路富集分析結(jié)果圖

              TCGA,GEO生信高通量數(shù)據(jù)挖掘?qū)n}學(xué)習(xí)班2019(1月上海班)

              示例圖 GO富集分析結(jié)果圖

              TCGA,GEO生信高通量數(shù)據(jù)挖掘?qū)n}學(xué)習(xí)班2019(1月上海班)

              示例圖 聚類(lèi)熱圖分析

              TCGA,GEO生信高通量數(shù)據(jù)挖掘?qū)n}學(xué)習(xí)班2019(1月上海班)

              示例圖 蛋白互作網(wǎng)絡(luò)圖

              TCGA,GEO生信高通量數(shù)據(jù)挖掘?qū)n}學(xué)習(xí)班2019(1月上海班)

              示例圖 pathway map圖

              TCGA,GEO生信高通量數(shù)據(jù)挖掘?qū)n}學(xué)習(xí)班2019(1月上海班)

              示例圖 關(guān)鍵基因的KM生存曲線(xiàn)圖

              TCGA,GEO生信高通量數(shù)據(jù)挖掘?qū)n}學(xué)習(xí)班2019(1月上海班)

              示例圖 venn圖

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              會(huì)議嘉賓 (最終出席嘉賓以會(huì)議現(xiàn)場(chǎng)為準(zhǔn))


              講師簡(jiǎn)介

              宋偉博士

              成果:參與完成了近百篇軟件著作權(quán)和發(fā)明專(zhuān)利的撰寫(xiě)和申請(qǐng);肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等數(shù)據(jù)庫(kù)的分析和構(gòu)建;完成個(gè)體基因檢測(cè)流程和無(wú)創(chuàng)唐篩流程的開(kāi)發(fā)。

              研究方向:有近十年的生信分析經(jīng)驗(yàn),擅長(zhǎng)方向有轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析、芯片數(shù)據(jù)分析、疾病機(jī)理研究分析、疾病預(yù)后與基因關(guān)聯(lián)分析、項(xiàng)目分析思路設(shè)計(jì)以及個(gè)性化分析等,精通perl、R等編程語(yǔ)言。

              培訓(xùn)經(jīng)歷:在上海、沈陽(yáng)、濟(jì)南、武漢等城市舉辦過(guò)十幾場(chǎng)培訓(xùn)班。培訓(xùn)的對(duì)象有:醫(yī)生、學(xué)生、科研工作者、生信愛(ài)好者等。

              培訓(xùn)方向:《測(cè)序與芯片數(shù)據(jù)分析》、《生物信息學(xué)的魅力》、《生信文章實(shí)例解讀》、《生信與實(shí)驗(yàn)的密切關(guān)系》、《生信與臨床醫(yī)學(xué)的關(guān)系》、《生信實(shí)用工具培訓(xùn)》、《多組學(xué)整合分析流程》、《R語(yǔ)言培訓(xùn)》等

              查看更多

              參會(huì)指南

              會(huì)議門(mén)票 場(chǎng)館介紹


              學(xué)習(xí)費(fèi)2800元每位(學(xué)習(xí)費(fèi)包含電子版教材、午餐,住宿費(fèi)自理,保證學(xué)員完全掌握。)

              優(yōu)惠政策:

              1. 提前支付轉(zhuǎn)賬的可提前拿到學(xué)習(xí)資料

              2. 三人組團(tuán)報(bào)名,每人收費(fèi)2700元

              3. ?四人組團(tuán)報(bào)名,每人收費(fèi)2600元

              4. ?五人組團(tuán)報(bào)名繳費(fèi),額外帶一人免費(fèi)注冊(cè)!?

              5. 參加過(guò)醫(yī)藥加測(cè)序與芯片數(shù)據(jù)挖掘的學(xué)員只要再支付1000元

              可以開(kāi)正規(guī)會(huì)務(wù)發(fā)票,紙質(zhì)邀請(qǐng)函(蓋紅章)。?

              注意事項(xiàng):攜帶windows系統(tǒng)的電腦,蘋(píng)果電腦請(qǐng)務(wù)必提前做好雙系統(tǒng)。現(xiàn)場(chǎng)不得錄音錄像。

              查看更多

              上海浦東中興和泰酒店 上海浦東中興和泰酒店

              交通指南:

              浦東張江地區(qū)駕車(chē)距離2.7公里(約6分鐘)、上海浦東國(guó)際機(jī)場(chǎng)駕車(chē)距離26.2公里(約42分鐘)、上海虹橋國(guó)際機(jī)場(chǎng)駕車(chē)距離30.5公里(約74分鐘)

              上海中興和泰酒店位于浦東張江高科技園區(qū)的核心地帶,附近有地鐵二號(hào)線(xiàn)張江高科站,毗鄰新國(guó)際博覽中心、磁懸浮車(chē)站,距離迪士尼度假區(qū)20分鐘車(chē)程左右;周邊生活設(shè)施齊全,有集餐飲、KTV、電影院等休閑娛樂(lè)為一體的綜合性休閑廣場(chǎng)。

                

                酒店占地面積一萬(wàn)多平方米,屬園林景觀(guān)式酒店,擁有精心裝修的各式客房,環(huán)境優(yōu)雅、舒適,特設(shè)園林景觀(guān)房、湖景套房。同時(shí)酒店全面覆蓋WIFI,讓你隨時(shí)隨地享受網(wǎng)上沖浪的樂(lè)趣。

                

                店內(nèi)有中、西餐廳、商務(wù)中心、大堂吧、10個(gè)中小型會(huì)議室、健身房、乒乓球室和SPA館,裝修溫馨舒適、服務(wù)貼心細(xì)致,讓你流連忘返。


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              酒店與住宿: 為防止極端情況下活動(dòng)延期或取消,建議“異地客戶(hù)”與活動(dòng)家客服確認(rèn)參會(huì)信息后,再安排出行與住宿。
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