課 程

內(nèi) 容

一、計算化學(xué)理論及程序入門操作

1?理論計算化學(xué)簡介——初識并掌握相關(guān)量子化學(xué)基礎(chǔ)知識，了解不同理論方法和基組

1.1?理論計算化學(xué)概述

1.2?量子化學(xué)理論方法介紹及選擇 ?????????

1.3?基組介紹及選擇

1.4?其他相關(guān)理論知識

2?Gaussian及GaussView操作基礎(chǔ)及應(yīng)用——經(jīng)過實際課堂任務(wù)計算，掌握程序畫圖和提交任務(wù)

2.1?Gaussian及GV安裝及設(shè)置（Win和Linux）

2.2?Gaussian基礎(chǔ)知識及入門操作

2.3?GaussView使用及初步結(jié)構(gòu)構(gòu)建

2.3.1 Linux中命令介紹，formchk，unfchk，freqchk等；

2.3.2 掌握GaussView畫圖基礎(chǔ)及Gaussian熟練提交任務(wù)。

2.4?深入認(rèn)識輸入文件和輸出文件（Win和Linux）：逐行解析

二、Gaussian基礎(chǔ)操作及實際計算過程

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3?Gaussian基礎(chǔ)操作Ⅰ：——掌握文章中初級結(jié)構(gòu)示意圖的輸出

3.1?波函數(shù)及軌道分析

3.2?單點(diǎn)能的計算及詳細(xì)數(shù)據(jù)獲得

3.3?獨(dú)立粒子模型

3.4?初步幾何優(yōu)化介紹

3.5?SCF收斂及穩(wěn)定性

3.6?HOMO-LUMO?圖輸出

3.7?繪制自旋密度圖

3.8?個性化示意圖的繪制

4?Gaussian基礎(chǔ)操作Ⅱ：——各個小節(jié)進(jìn)行相應(yīng)的實際計算

4.1?幾何優(yōu)化的算法及優(yōu)化結(jié)構(gòu)合理性判定方法

4.2?實時監(jiān)控優(yōu)化過程

4.3?優(yōu)化中出錯的解決

4.4?振動分析

4.5?高斯計算過程常見報錯信息總結(jié)及解決辦法

三、Gaussian進(jìn)階操作及實際計算過程

5?Gaussian進(jìn)階操作Ⅰ：——各個小節(jié)進(jìn)行相應(yīng)的實際計算

5.1?紅外光譜

5.2?拉曼光譜

5.3?NMR計算

5.4?溶劑模型

5.5?垂直電離能及垂直電子親和能的計算

6?Gaussian進(jìn)階操作Ⅱ：——各個小節(jié)進(jìn)行相應(yīng)的實際計算

6.1?過渡態(tài)搜索

6.2?勢能面掃描

6.3?IRC計算

6.4?化學(xué)反應(yīng)及反應(yīng)路徑計算

四、Gaussian計算實踐專題與應(yīng)用

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7?Gaussian計算專題I——反應(yīng)熱力學(xué)性質(zhì)計算

7.1?熱力學(xué)應(yīng)用

7.2?反應(yīng)能壘

7.3?反應(yīng)熱力學(xué)數(shù)據(jù)獲得：熵，焓，內(nèi)能，零點(diǎn)能，吉布斯自由能的計算

8?Gaussian計算專題II——評估反應(yīng)計算

8.1?過渡態(tài)搜索，各種文件解讀及圖形繪制

8.2?結(jié)合熱力學(xué)計算評估反應(yīng)

9?Gaussian計算專題III——模擬文獻(xiàn)計算方法

9.1?Fukui函數(shù)介紹

9.2?親點(diǎn)、親核和自由基攻擊

9.3?位點(diǎn)預(yù)測方法

9.4?文獻(xiàn)中圖形繪制及數(shù)據(jù)分析方法（模擬文獻(xiàn) Water Res. 2019,162:369-382）

10?Gaussian計算專題IV——靜電勢及預(yù)測位點(diǎn)計算

10.1?靜電勢計算及圖形繪制

10.2?計算熱力學(xué)能量

10.3?使用Fukui函數(shù)預(yù)測位點(diǎn)

11?其他相關(guān)軟件介紹,如VMD、MS、VASP、LAMMPS、Gromacs等